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La optimización de protocolos para la extracción de ADN de muestras fecales

La secuenciación de alto rendimiento ofrece nuevas posibilidades en ecología molecular y biología de la conservación. Sin embargo, el potencial de esta técnica no ha sido totalmente explotado para estudios no invasivos, a partir de muestras fecales, de fauna silvestre. La secuenciación de alto rendimiento permite la secuenciación de fragmentos de ADN cortos y podría permitir el genotipado simultáneo de un gran número de muestras y marcadores a un bajo coste. La aplicación de estas técnicas a muestras fecales de fauna silvestre ha sido obstaculizada por la gran cantidad de trabajo requerido en varios pasos, desde la recolección de muestras hasta la secuenciación. Se han evaluado protocolos alternativos que podrían permitir un mayor rendimiento en dos de estos pasos: muestreo de campo y extracción de ADN. En este trabajo se compararon dos métodos distintos de conservación de las muestras obtenidas en el campo y siete métodos de extracción de ADN para heces de lobos (Canis lupus). Se observó una gran variación en el éxito de genotipado según los protocolos que se sigan. El método de muestreo de campo basado en frotado superficial de los excrementos dio resultados peores que la recolección de un fragmento del excremento. Por otro lado, los protocolos para la extracción de ADN mostraban resultados muy variables y ofrecen mucho margen de optimización y mejora. La optimización de protocolos puede llevar a un monitoreo no invasivo mucho más eficiente, económico y con mayor rendimiento. La selección de marcadores apropiados sigue siendo de importancia vital para incrementar el éxito de genotipado. informacion[at]ebd.csic.es: Sarabia et al (2020) Towards high-throughput analyses of fecal samples from wildlife. Animal Biodiver Conserv 43.2: 271–283 Doi 10.32800/abc.2020.43.0271


http://abc.museucienciesjournals.cat/volum-43-2-2020/towards-high-throughput-analyses-of-fecal-samples-from-wildlife/?lang=en
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¡Espejito, espejito! ¿Qué hábitat debo elegir?

¡Espejito, espejito! ¿Qué hábitat debo elegir?

La hipótesis de adecuación al hábitat sostiene que los individuos seleccionan aquellos hábitats a los que están mejor adaptados, maximizando así su eficacia biológica. Este mecanismo tiene consecuencias ecológicas y evolutivas potencialmente relevantes, pero sorprendentemente pocos estudios han evaluado sus predicciones. En este trabajo, se utilizaron 26 años de datos recogidos en una población de papamoscas cerrojillo para investigar el efecto del fenotipo sobre los patrones de dispersión y selección de hábitat y, en último término, sobre la eficacia biológica (éxito de reclutamiento). En la población de estudio, el tamaño corporal determina la direccionalidad de dispersión en los machos y, como resultado, individuos grandes y pequeños seleccionan, respectivamente, bosques caducifolios y de coníferas. De acuerdo con la hipótesis de adecuación al hábitat, cabría esperar que machos de diferente tamaño aumentaran su eficacia biológica seleccionando hábitats de nidificación diferentes. Los resultados mostraron que, en el bosque caducifolio, donde tienden a concentrarse los individuos más grandes, el éxito de reclutamiento resultó independiente del tamaño corporal. En el bosque de coníferas, donde los machos más pequeños son particularmente abundantes, el éxito de reclutamiento fue máximo en los machos de tamaño medio y muy bajo en los pequeños. Estos resultados no apoyan la operatividad de la hipótesis de adecuación al hábitat y, por tanto, aún carecemos de una demostración concluyente en la naturaleza. informacion[at]ebd.csic.es: Camacho et al (2015) Testing the matching habitat choice hypothesis in nature: phenotype-environment correlation and fitness in a songbird population. Evol Ecol 29: 873–886; DOI 10.1007/s10682-015-9793-4


http://link.springer.com/article/10.1007/s10682-015-9793-4