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La optimización de protocolos para la extracción de ADN de muestras fecales

La secuenciación de alto rendimiento ofrece nuevas posibilidades en ecología molecular y biología de la conservación. Sin embargo, el potencial de esta técnica no ha sido totalmente explotado para estudios no invasivos, a partir de muestras fecales, de fauna silvestre. La secuenciación de alto rendimiento permite la secuenciación de fragmentos de ADN cortos y podría permitir el genotipado simultáneo de un gran número de muestras y marcadores a un bajo coste. La aplicación de estas técnicas a muestras fecales de fauna silvestre ha sido obstaculizada por la gran cantidad de trabajo requerido en varios pasos, desde la recolección de muestras hasta la secuenciación. Se han evaluado protocolos alternativos que podrían permitir un mayor rendimiento en dos de estos pasos: muestreo de campo y extracción de ADN. En este trabajo se compararon dos métodos distintos de conservación de las muestras obtenidas en el campo y siete métodos de extracción de ADN para heces de lobos (Canis lupus). Se observó una gran variación en el éxito de genotipado según los protocolos que se sigan. El método de muestreo de campo basado en frotado superficial de los excrementos dio resultados peores que la recolección de un fragmento del excremento. Por otro lado, los protocolos para la extracción de ADN mostraban resultados muy variables y ofrecen mucho margen de optimización y mejora. La optimización de protocolos puede llevar a un monitoreo no invasivo mucho más eficiente, económico y con mayor rendimiento. La selección de marcadores apropiados sigue siendo de importancia vital para incrementar el éxito de genotipado. informacion[at]ebd.csic.es: Sarabia et al (2020) Towards high-throughput analyses of fecal samples from wildlife. Animal Biodiver Conserv 43.2: 271–283 Doi 10.32800/abc.2020.43.0271


http://abc.museucienciesjournals.cat/volum-43-2-2020/towards-high-throughput-analyses-of-fecal-samples-from-wildlife/?lang=en
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“Obsolescencia planificada” en el plumaje de las especies de alaúdidos

"Obsolescencia planificada" en el plumaje de las especies de alaúdidos

Los alaúdidos presentan un plumaje muy desgastado durante la mayor parte del ciclo anual, hasta el punto de que las guías de campo de identificación representan típicamente especies de alondras tanto en el plumaje fresco como en el desgastado. La naturaleza efímera de las plumas de la alondra es aún más extraña sabiendo que las alondras se encuentran entre los pocos paseriformes que sufren una sola muda anual. Por el contrario, la mayoría de las aves canoras muda plumas dos veces al año. Las alondras son aves de color inconspicuo que habitan en el suelo y viven en áreas abiertas, ocupando así un nicho donde la abrasión por el aire y las partículas del suelo es máxima. Se ha observado que las plumas de alondra tienen flecos sin melanizar y son propensas a romperse. Las alondras pueden haber hecho de necesidad virtud: posiblemente no pueden evitar un daño prematuro de su frágil plumaje y, en lugar de incurrir en repetidas y costosas mudas, obtienen la ventaja de una forma de cripsis conocida como camuflaje disruptivo. Cuando se rompen las plumas, crean un patrón serrado aleatorio, que anula el efecto de las líneas suaves que los depredadores detectan más fácilmente. informacion[at]ebd.csic.es: Negro et al (2019) Adaptive plumage wear for increased crypsis in the plumage of Palearctic larks (Alaudidae). Ecology https://doi.org/10.1002/ecy.2771


https://esajournals.onlinelibrary.wiley.com/doi/full/10.1002/ecy.2771