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La optimización de protocolos para la extracción de ADN de muestras fecales

La secuenciación de alto rendimiento ofrece nuevas posibilidades en ecología molecular y biología de la conservación. Sin embargo, el potencial de esta técnica no ha sido totalmente explotado para estudios no invasivos, a partir de muestras fecales, de fauna silvestre. La secuenciación de alto rendimiento permite la secuenciación de fragmentos de ADN cortos y podría permitir el genotipado simultáneo de un gran número de muestras y marcadores a un bajo coste. La aplicación de estas técnicas a muestras fecales de fauna silvestre ha sido obstaculizada por la gran cantidad de trabajo requerido en varios pasos, desde la recolección de muestras hasta la secuenciación. Se han evaluado protocolos alternativos que podrían permitir un mayor rendimiento en dos de estos pasos: muestreo de campo y extracción de ADN. En este trabajo se compararon dos métodos distintos de conservación de las muestras obtenidas en el campo y siete métodos de extracción de ADN para heces de lobos (Canis lupus). Se observó una gran variación en el éxito de genotipado según los protocolos que se sigan. El método de muestreo de campo basado en frotado superficial de los excrementos dio resultados peores que la recolección de un fragmento del excremento. Por otro lado, los protocolos para la extracción de ADN mostraban resultados muy variables y ofrecen mucho margen de optimización y mejora. La optimización de protocolos puede llevar a un monitoreo no invasivo mucho más eficiente, económico y con mayor rendimiento. La selección de marcadores apropiados sigue siendo de importancia vital para incrementar el éxito de genotipado. informacion[at]ebd.csic.es: Sarabia et al (2020) Towards high-throughput analyses of fecal samples from wildlife. Animal Biodiver Conserv 43.2: 271–283 Doi 10.32800/abc.2020.43.0271


http://abc.museucienciesjournals.cat/volum-43-2-2020/towards-high-throughput-analyses-of-fecal-samples-from-wildlife/?lang=en
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Acumulación de contaminantes en el cerebro de delfines

Acumulación de contaminantes en el cerebro de delfines

Los contaminantes retardantes de llama, tanto los clásicos como sus sustitutos, son capaces de atravesar la barrera hematoencefálica de los cetáceos y penetrar en el cerebro, según se desprende de este estudio. Se han analizado los retardantes de llama clásicos (los PBDE ya prohibidos) y sus sustitutos (los retardantes de llama emergentes). También se han analizado la presencia de otras moléculas parecidas aunque de origen natural, unos compuestos bromados generados por algas y esponjas. Todos estos compuestos han sido hallados en el cerebro de los delfines analizados, confirmando que son capaces de traspasar la barrera hematoencefálica. ¿Por qué estos compuestos, tanto los contaminantes como las moléculas parecidas de origen natural,  atraviesan  la barrera hematoencefálica? ¿Tienen efectos neurológicos? ¿Puede estar sucediendo lo mismo con los humanos? Según los resultados del trabajo, las concentraciones son diferentes para cada uno de los compuestos estudiados, dependiendo en cada caso de la facilidad para penetrar en el cerebro. Los mayores niveles hallados son los de los nuevos retardantes de llama que están en el mercado como sustitutos de los prohibidos PBDE, lo que demostraría que tienen mayor capacidad de atravesar la membrana hematoencefálica. Le siguen los PBDE y, por último, los compuestos bromados naturales. Esto implica la necesidad de realizar estudios que evalúen los posibles efectos neurológicos de estos nuevos retardantes de llama. Podría ocurrir que los nuevos retardantes sean aún más nocivos que los ya prohibidos PBDE. informacion[at]ebd.csic.es: Baron et al (2015) Halogenated Natural Products in Dolphins: Brain–Blubber Distribution and Comparison with Halogenated Flame Retardants. Environ Sci Technol DOI: 10.1021/acs.est.5b02736


http://pubs.acs.org/doi/full/10.1021/acs.est.5b02736