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La optimización de protocolos para la extracción de ADN de muestras fecales

La secuenciación de alto rendimiento ofrece nuevas posibilidades en ecología molecular y biología de la conservación. Sin embargo, el potencial de esta técnica no ha sido totalmente explotado para estudios no invasivos, a partir de muestras fecales, de fauna silvestre. La secuenciación de alto rendimiento permite la secuenciación de fragmentos de ADN cortos y podría permitir el genotipado simultáneo de un gran número de muestras y marcadores a un bajo coste. La aplicación de estas técnicas a muestras fecales de fauna silvestre ha sido obstaculizada por la gran cantidad de trabajo requerido en varios pasos, desde la recolección de muestras hasta la secuenciación. Se han evaluado protocolos alternativos que podrían permitir un mayor rendimiento en dos de estos pasos: muestreo de campo y extracción de ADN. En este trabajo se compararon dos métodos distintos de conservación de las muestras obtenidas en el campo y siete métodos de extracción de ADN para heces de lobos (Canis lupus). Se observó una gran variación en el éxito de genotipado según los protocolos que se sigan. El método de muestreo de campo basado en frotado superficial de los excrementos dio resultados peores que la recolección de un fragmento del excremento. Por otro lado, los protocolos para la extracción de ADN mostraban resultados muy variables y ofrecen mucho margen de optimización y mejora. La optimización de protocolos puede llevar a un monitoreo no invasivo mucho más eficiente, económico y con mayor rendimiento. La selección de marcadores apropiados sigue siendo de importancia vital para incrementar el éxito de genotipado. informacion[at]ebd.csic.es: Sarabia et al (2020) Towards high-throughput analyses of fecal samples from wildlife. Animal Biodiver Conserv 43.2: 271–283 Doi 10.32800/abc.2020.43.0271


http://abc.museucienciesjournals.cat/volum-43-2-2020/towards-high-throughput-analyses-of-fecal-samples-from-wildlife/?lang=en
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Asociación negativa entre heterogeneidad e intensidad del color del plumaje generado por melaninas en aves

Asociación negativa entre heterogeneidad e intensidad del color del plumaje generado por melaninas en aves

A pesar de que la diversidad del plumaje es uno de los rasgos fenotípicos más diversos de la naturaleza, las razones por las que algunas especies exhiben colores más distintivos que otras son escasamente conocidas. En el caso de las melaninas, los pigmentos más abundantes en las aves, diferentes formas químicas generan diferentes colores del plumaje, y diferentes cantidades de estas formas generan diferentes intensidades de color. Sin embargo, la síntesis de algunas formas de melaninas está más limitada fisiológicamente que otras. Se hipotetiza que una solución evolutiva a este escenario puede consistir en una asociación negativa entre la heterogeneidad y la intensidad del color generado por melaninas. Aquí se confirma esta predicción después de analizar la diversidad y el nivel de expresión de colores generados por melaninas en 96 especies de aves reproductoras en la península Ibérica. Después de controlar por efectos filogenéticos, la intensidad de los colores del plumaje de las aves disminuyó al aumentar el número de diferentes colores, sugiriendo que el mecanismo fisiológico de síntesis de melaninas no favorece la producción de tanto una heterogeneidad de formas de melaninas como de altas cantidades de estas formas. Estos resultados contribuyen a obtener una mejor comprensión de la diversidad fenotípica de las aves. informacion[at]ebd.csic.es: Galván & Rodríguez-Martínez (2019) A negative association between melanin-based plumaje color heterogeneity and intensity in birds. Physiol Biochem Zool https://doi.org/10.1086/702720


https://www.journals.uchicago.edu/doi/abs/10.1086/702720