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La optimización de protocolos para la extracción de ADN de muestras fecales

La secuenciación de alto rendimiento ofrece nuevas posibilidades en ecología molecular y biología de la conservación. Sin embargo, el potencial de esta técnica no ha sido totalmente explotado para estudios no invasivos, a partir de muestras fecales, de fauna silvestre. La secuenciación de alto rendimiento permite la secuenciación de fragmentos de ADN cortos y podría permitir el genotipado simultáneo de un gran número de muestras y marcadores a un bajo coste. La aplicación de estas técnicas a muestras fecales de fauna silvestre ha sido obstaculizada por la gran cantidad de trabajo requerido en varios pasos, desde la recolección de muestras hasta la secuenciación. Se han evaluado protocolos alternativos que podrían permitir un mayor rendimiento en dos de estos pasos: muestreo de campo y extracción de ADN. En este trabajo se compararon dos métodos distintos de conservación de las muestras obtenidas en el campo y siete métodos de extracción de ADN para heces de lobos (Canis lupus). Se observó una gran variación en el éxito de genotipado según los protocolos que se sigan. El método de muestreo de campo basado en frotado superficial de los excrementos dio resultados peores que la recolección de un fragmento del excremento. Por otro lado, los protocolos para la extracción de ADN mostraban resultados muy variables y ofrecen mucho margen de optimización y mejora. La optimización de protocolos puede llevar a un monitoreo no invasivo mucho más eficiente, económico y con mayor rendimiento. La selección de marcadores apropiados sigue siendo de importancia vital para incrementar el éxito de genotipado. informacion[at]ebd.csic.es: Sarabia et al (2020) Towards high-throughput analyses of fecal samples from wildlife. Animal Biodiver Conserv 43.2: 271–283 Doi 10.32800/abc.2020.43.0271


http://abc.museucienciesjournals.cat/volum-43-2-2020/towards-high-throughput-analyses-of-fecal-samples-from-wildlife/?lang=en
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Cambios en la metilación de ARN y ADN de melanocitos favorecen la síntesis de feomelanina y pueden evitar estrés oxidativo tras la suplementación de cisteína dietética en aves

Cambios en la metilación de ARN y ADN de melanocitos favorecen la síntesis de feomelanina y pueden evitar estrés oxidativo tras la suplementación de cisteína dietética en aves

La cisteína desempeña funciones biológicas esenciales, pero en cantidades excesivas produce estrés oxidativo celular. El metabolismo de la cisteína es mediado principalmente por las enzimas cisteína dioxigenasa y ?-glutamilcisteína sintetasa, respectivamente codificadas por los genes CDO1 and GCLC. Aquí se examina una nueva hipótesis que establece que la síntesis del pigmento feomelanina también contribuye a la homeostasis de cisteína en los melanocitos, donde la cisteína puede entrar en la vía de feomelanogénesis. Se realiza un experimento con el trepador azul Sitta europaea, un ave que produce elevadas cantidades de feomelanina para pigmentar sus plumas, para investigar si los melanocitos muestran labilidad epigenética bajo exposición a un exceso de cisteína. Se incrementan los niveles sistémicos de cisteína en trepadores azules suplementándolos con cisteína dietética durante el crecimiento. Esto produjo en melanocitos de plumas la disminución en la expresión de genes implicados en el metabolismo intracelular de cisteína (GCLC), en el transporte de cisteína al citosol desde el medio extracelular (Slc7a11) y desde los melanosomas (CTNS), y en la regulación de la actividad de la tirosinasa (MC1R and ASIP). Estos cambios fueron mediados por incrementos de m5C en el ADN en todos los genes excepto en Slc7a11, que experimentó una reducción de m6A en el ARN. Las aves suplementadas con cisteína sintetizaron más feomelanina que los controles, pero no sufrieron un mayor estrés oxidativo sistémico. Estos resultados sugieren que el exceso de cisteína activa un mecanismo epigenético que favorece la síntesis de feomelanina y puede proteger del estrés oxidativo. informacion[at]ebd.csic.es: Rodríguez-Martínez et al (2019) Changes in melanocyte RNA and DNA methylation favor pheomelanin synthesis and may avoid systemic oxidative stress after dietary cysteine supplementation in birds


https://onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1111/mec.15024