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La estrategia que adopta la sabina mora para tolerar sequías difiere según el sitio

Los episodios de mortalidad de vegetación inducidos por eventos extremos de sequía en ecosistemas forestales están siendo ampliamente estudiados, pero no así en las formaciones arbustivas o matorrales. En este sentido suele asumirse que las plantas con estrés crónico son más vulnerables a la sequía desencadenando su muerte. En este trabajo se han analizado los eventos de mortalidad provocados por la sequía en matorrales mediterráneos dominados por la sabina mora Juniperus phoenicea en dos sitios con condiciones climáticas y de suelo contrastantes ubicadas en España. Se han caracterizado los patrones de crecimiento radial de sabinas vivas y muertas coexistentes, incluido el cálculo de estadísticas de crecimiento utilizadas como señales de alerta temprana, crecimiento en respuesta a las variaciones climáticas y se analizó la concentración de los isótopos de C y O en la madera. En la localidad de interior, sitio continental con sustratos rocosos (Yaso, Huesca), las sabinas muertas mostraron un crecimiento menor que los individuos vivos durante las tres décadas previas a su muerte en 2016. Sin embargo, en el sitio costero, templado y suelos arenosos (Reserva Biológica de Doñana, Huelva), las sabinas muertas eran en general de menor tamaño pero crecieron más que los individuos aún vivos durante las últimas dos décadas antes de su muerte en 2005. Los únicos patrones comunes entre ambos sitios fueron la mayor coherencia de crecimiento en las sabinas vivas y muertas antes de la muerte y la disminución en el crecimiento observado en los individuos finalmente muertos. Para toda la cronología, se encontró en ambos sitios que unas condiciones frescas y húmedas durante el invierno y primavera previos, junto con las menores temperatura en verano incrementaron los crecimientos de las sabinas. En Doñana, el crecimiento de las sabinas vivas se redujo más por las cálidas condiciones de julio que en el caso de los individuos muertos. Los valores más altos de ?13C en Yaso indican también un estrés por sequía más pronunciado. En Yaso, las sabinas muertas presentaron valores más bajos de ?18O, mientras que en Doñana ocurrió lo contrario, lo que sugiere diferentes cambios en la conductancia estomática antes de la muerte. Un verano muy cálido aumenta las tasas de evapotranspiración y desencadena la muerte en esta especie de raíces poco profundas, particularmente en sitios con poca capacidad de retención de agua. Se concluye que el crecimiento crónico lento no siempre es un predictor robusto de mortalidad provocada por sequía. informacion[at]ebd.csic.es: Camarero et al (2020) Dieback and mortality of junipers caused by drought: Dissimilar growth and wood isotope patterns preceding shrub death. Agr Forest Meteorol 291, 108078. DOI 10.1016/j.agrformet.2020.108078


https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0168192320301805?dgcid=author#ack0001
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Caracterización del genoma accesible en el parásito de la malaria humana Plasmodium falciparum

Caracterización del genoma accesible en el parásito de la malaria humana Plasmodium falciparum

La malaria humana es una enfermedad devastadora y causa de pobreza en países en vías de desarrollo. Para desarrollarse y adaptarse a las condiciones cambiantes dentro del huésped Plasmodium falciparum experimenta cambios drásticos en la expresión de los genes. Con el objetivo de identificar regiones reguladoras en el genoma del parásito, se ha caracterizado el perfil de accesibilidad a la cromatina en dos líneas clonales en cuatro etapas del desarrollo durante el ciclo intraeritrocítico en sangre mediante la técnica del ATAC-seq. Se encontró que las regiones abiertas de la cromatina localizan preferentemente en los sitios de inicio de la transcripción (TSS). La accesibilidad a la cromatina por ATAC-seq es predictiva del nivel de transcripción activa y de los niveles de enriquecimiento de marcas de histonas H3K9ac y H3K4me3. Este ensayo ha permitido además identificar nuevas regiones reguladoras incluyendo TSS y elementos tipo enhancer. En este estudio se muestra que la dinámica de la accesibilidad de la cromatina coincide con los patrones temporales de expresión durante el desarrollo. El análisis de motivos enriquecidos en las regiones reguladoras activas específicas en cada etapa permite predecir los sitios de unión in vivo y la función de múltiples factores de transcripción ApiAP2. Por último, el estado de expresión activo de genes clonales variantes implicados en virulencia:  eba, phist, var y clag; está asociado a una señal de ATAC-seq diferencial en el promotor. En conjunto, este estudio identifica las regiones reguladoras del genoma con un papel esencial en el desarrollo del parásito y en la expresión clonal variante en P. falciparum. informacion[at]ebd.csic.es: Ruiz et al (2018) Characterization of the accessible genome in the human malaria parasite Plasmodium falciparum. Nucleic Acids Res https://doi.org/10.1093/nar/gky643


https://academic.oup.com/nar/advance-article/doi/10.1093/nar/gky643/5054866?guestAccessKey=c45cf7d4-f086-449f-a39e-246f7a8122fe