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La optimización de protocolos para la extracción de ADN de muestras fecales

La secuenciación de alto rendimiento ofrece nuevas posibilidades en ecología molecular y biología de la conservación. Sin embargo, el potencial de esta técnica no ha sido totalmente explotado para estudios no invasivos, a partir de muestras fecales, de fauna silvestre. La secuenciación de alto rendimiento permite la secuenciación de fragmentos de ADN cortos y podría permitir el genotipado simultáneo de un gran número de muestras y marcadores a un bajo coste. La aplicación de estas técnicas a muestras fecales de fauna silvestre ha sido obstaculizada por la gran cantidad de trabajo requerido en varios pasos, desde la recolección de muestras hasta la secuenciación. Se han evaluado protocolos alternativos que podrían permitir un mayor rendimiento en dos de estos pasos: muestreo de campo y extracción de ADN. En este trabajo se compararon dos métodos distintos de conservación de las muestras obtenidas en el campo y siete métodos de extracción de ADN para heces de lobos (Canis lupus). Se observó una gran variación en el éxito de genotipado según los protocolos que se sigan. El método de muestreo de campo basado en frotado superficial de los excrementos dio resultados peores que la recolección de un fragmento del excremento. Por otro lado, los protocolos para la extracción de ADN mostraban resultados muy variables y ofrecen mucho margen de optimización y mejora. La optimización de protocolos puede llevar a un monitoreo no invasivo mucho más eficiente, económico y con mayor rendimiento. La selección de marcadores apropiados sigue siendo de importancia vital para incrementar el éxito de genotipado. informacion[at]ebd.csic.es: Sarabia et al (2020) Towards high-throughput analyses of fecal samples from wildlife. Animal Biodiver Conserv 43.2: 271–283 Doi 10.32800/abc.2020.43.0271


http://abc.museucienciesjournals.cat/volum-43-2-2020/towards-high-throughput-analyses-of-fecal-samples-from-wildlife/?lang=en
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De los vertederos a los lagos: las gaviotas como transportadoras de nutrientes

De los vertederos a los lagos: las gaviotas como transportadoras de nutrientes

La eutrofización en sistemas acuáticos es un problema global con implicaciones tanto económicas como ecológicas. La guanotrofización ocurre cuando las aves acuáticas utilizan lagos como dormideros e importan nutrientes (N y P por ejemplo) desde los sistemas terrestres de los alrededores. Hasta ahora se cuantificaba el efecto de las aves basándose en censos sin tener en cuenta sus movimientos reales. En este estudio se ha cuantificado la aportación de nutrientes por la gaviota sombría Larus fuscus en la Laguna de Fuente de Piedra en Andalucía, uno de los dormideros de gaviota sombría más importantes de la zona. Durante siete inviernos de 2010 a 2017, se utilizaron datos GPS de movimientos de 20 gaviotas sombrías que se alimentaban en cuatro vertederos. Combinando los movimientos con el análisis de N y P de excreta y censos mensuales, se cuantificó la entrada total nutrientes por invierno. Los datos de movimiento ayudaron a estimar la proporción del tiempo que pasan las gaviotas en Fuente de Piedra, pero también a corregir los censos, ya que a la hora que se realizaban los conteos muchos individuos (un 69% de ellos) ya habían salido del dormidero para alimentarse. La importación de nutrientes dependió sobre todo del tiempo pasado en la laguna, el cual aumentó en los inviernos recientes y dependía en parte de los niveles de agua de la laguna. Se estimó una media de 10.17 Kg N/ha año y 2.07 Kg P/ha año con los niveles más altos en 2016-2017. El guano de las gaviotas es la entrada de nutrientes más importante en la laguna durante el invierno. El aporte de nutrientes de egagrópilas se había ignorado hasta ahora en otros estudios, pero es un aporte de P más importante que los excrementos. La utilización de datos movimiento puede mejorar los estudios de guanotrofizacion mediante la identificación del origen de los nutrientes, corrigiendo los censos y estimando los tiempos de permanencia en los dormideros. informacion[at]ebd.csic.es: Martín-Vélez et al (2019). Quantifying nutrient inputs by gulls to a fluctuating lake aided by movement ecology methods. Freshwater Biol https://doi.org/10.1111/fwb.13374


https://onlinelibrary.wiley.com/doi/full/10.1111/fwb.13374