Noticias Noticias

La optimización de protocolos para la extracción de ADN de muestras fecales

La secuenciación de alto rendimiento ofrece nuevas posibilidades en ecología molecular y biología de la conservación. Sin embargo, el potencial de esta técnica no ha sido totalmente explotado para estudios no invasivos, a partir de muestras fecales, de fauna silvestre. La secuenciación de alto rendimiento permite la secuenciación de fragmentos de ADN cortos y podría permitir el genotipado simultáneo de un gran número de muestras y marcadores a un bajo coste. La aplicación de estas técnicas a muestras fecales de fauna silvestre ha sido obstaculizada por la gran cantidad de trabajo requerido en varios pasos, desde la recolección de muestras hasta la secuenciación. Se han evaluado protocolos alternativos que podrían permitir un mayor rendimiento en dos de estos pasos: muestreo de campo y extracción de ADN. En este trabajo se compararon dos métodos distintos de conservación de las muestras obtenidas en el campo y siete métodos de extracción de ADN para heces de lobos (Canis lupus). Se observó una gran variación en el éxito de genotipado según los protocolos que se sigan. El método de muestreo de campo basado en frotado superficial de los excrementos dio resultados peores que la recolección de un fragmento del excremento. Por otro lado, los protocolos para la extracción de ADN mostraban resultados muy variables y ofrecen mucho margen de optimización y mejora. La optimización de protocolos puede llevar a un monitoreo no invasivo mucho más eficiente, económico y con mayor rendimiento. La selección de marcadores apropiados sigue siendo de importancia vital para incrementar el éxito de genotipado. informacion[at]ebd.csic.es: Sarabia et al (2020) Towards high-throughput analyses of fecal samples from wildlife. Animal Biodiver Conserv 43.2: 271–283 Doi 10.32800/abc.2020.43.0271


http://abc.museucienciesjournals.cat/volum-43-2-2020/towards-high-throughput-analyses-of-fecal-samples-from-wildlife/?lang=en
Promedio (0 Votos)

Últimas noticias Últimas noticias

Atrás

Déficit de datos y oportunidades para la biología comparada y de la conservación

Déficit de datos y oportunidades para la biología comparada y de la conservación

Necesitamos urgentemente medidas de conservación basadas en la evidencia para proteger la creciente proporción de especies en peligro, especialmente dadas las actuales tasas de extinción. En última instancia la extinción de una especie viene determinada por la diferencia entre las tasas de natalidad y mortalidad de sus poblaciones, que hace que éstas aumenten o entren en declive. Por esa razón los datos demográficos son esenciales para informar las políticas de gestión encaminadas a la conservación y para estimar el riesgo de extinción. La información demográfica constituye por tanto una base necesaria para abordar una gestión sostenible de las especies además de profundizar nuestra comprensión de los procesos ecológicos y evolutivos. Aquí se desarrolla un Índice del Conocimiento Demográfico de las especies que clasifica la información demográfica para 32.144 especies de tetrápodos. Únicamente se encuentra información exhaustiva sobre natalidad y supervivencia para el 1,3% de las especies (613). Se muestra también el potencial de zoológicos y acuarios como contribuyentes de nuestro conocimiento demográfico. informacion[at]ebd.csic.es: Conde et al (2019) Data gaps and opportunities for comparative and conservation biology. Proc Natl Acad Sci USA https://doi.org/10.1073/pnas.1816367116


https://www.pnas.org/content/early/2019/04/18/1816367116