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La optimización de protocolos para la extracción de ADN de muestras fecales

La secuenciación de alto rendimiento ofrece nuevas posibilidades en ecología molecular y biología de la conservación. Sin embargo, el potencial de esta técnica no ha sido totalmente explotado para estudios no invasivos, a partir de muestras fecales, de fauna silvestre. La secuenciación de alto rendimiento permite la secuenciación de fragmentos de ADN cortos y podría permitir el genotipado simultáneo de un gran número de muestras y marcadores a un bajo coste. La aplicación de estas técnicas a muestras fecales de fauna silvestre ha sido obstaculizada por la gran cantidad de trabajo requerido en varios pasos, desde la recolección de muestras hasta la secuenciación. Se han evaluado protocolos alternativos que podrían permitir un mayor rendimiento en dos de estos pasos: muestreo de campo y extracción de ADN. En este trabajo se compararon dos métodos distintos de conservación de las muestras obtenidas en el campo y siete métodos de extracción de ADN para heces de lobos (Canis lupus). Se observó una gran variación en el éxito de genotipado según los protocolos que se sigan. El método de muestreo de campo basado en frotado superficial de los excrementos dio resultados peores que la recolección de un fragmento del excremento. Por otro lado, los protocolos para la extracción de ADN mostraban resultados muy variables y ofrecen mucho margen de optimización y mejora. La optimización de protocolos puede llevar a un monitoreo no invasivo mucho más eficiente, económico y con mayor rendimiento. La selección de marcadores apropiados sigue siendo de importancia vital para incrementar el éxito de genotipado. informacion[at]ebd.csic.es: Sarabia et al (2020) Towards high-throughput analyses of fecal samples from wildlife. Animal Biodiver Conserv 43.2: 271–283 Doi 10.32800/abc.2020.43.0271


http://abc.museucienciesjournals.cat/volum-43-2-2020/towards-high-throughput-analyses-of-fecal-samples-from-wildlife/?lang=en
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Dicromatismo sexual en las aves del Paleártico occidental

Dicromatismo sexual en las aves del Paleártico occidental

Las melaninas son los pigmentos más comunes que proporcionan coloración al plumaje y a la piel desnuda de las aves y de otros vertebrados. Numerosas especies son dicromáticas en el plumaje adulto o definitivo, pero el sentido de este tipo de dicromatismo sexual (es decir, si un sexo tiende a ser más oscuro que el otro) no se ha investigado a fondo. Aquí se han utilizado placas de color para analizar la presencia de parches de coloración por melanina en 666 especies pertenecientes a 69 familias que se reproducen regularmente en el Paleártico occidental. El 30.7 % de las especies presentó dicromatismo sexual basado en melaninas en al menos una parte de la piel. Las partes del cuerpo que contribuyeron con mayor frecuencia al dicromatismo fueron las áreas dorsal, cabeza y pecho, mientras que las partes menos dicromáticas del cuerpo fueron el vientre y las partes de la piel expuestas (es decir, pico y patas). Respecto a la extensión filogenética de los dicromatismos, 37 familias (53.6%) presentaban al menos una especie con dimorfismo sexual basado en melaninas en el plumaje definitivo del adulto. Los machos son más oscuros que las hembras en la mayoría de las especies, lo que significa que los machos tienden a producir más eumelanina y las hembras tienden a sintetizar más feomelanina. Este estudio ha revelado la alta prevalencia de melaninas en la aparición del dicromatismo sexual en las aves, al menos en el Paleártico occidental. Todavía debe esclarecerse si el patrón descrito se debe a una selección sexual que promueve machos más conspicuos o a una selección natural que favorece hembras con plumaje más críptico. Dado que la síntesis de feomelanina al mismo tiempo consume el antioxidante glutatión y reduce la cisteína tóxica, los factores fisiológicos sesgados por el sexo también deben tenerse en cuenta en la evolución del plumaje de las aves. informacion[at]ebd.csic.es Negro et al (2018) Melanin-based sexual dichromatism in the Western Palearctic avifauna implies darker males and lighter females. J Avian Biol doi:10.1111/jav.01657


http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/jav.01657/full