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La optimización de protocolos para la extracción de ADN de muestras fecales

La secuenciación de alto rendimiento ofrece nuevas posibilidades en ecología molecular y biología de la conservación. Sin embargo, el potencial de esta técnica no ha sido totalmente explotado para estudios no invasivos, a partir de muestras fecales, de fauna silvestre. La secuenciación de alto rendimiento permite la secuenciación de fragmentos de ADN cortos y podría permitir el genotipado simultáneo de un gran número de muestras y marcadores a un bajo coste. La aplicación de estas técnicas a muestras fecales de fauna silvestre ha sido obstaculizada por la gran cantidad de trabajo requerido en varios pasos, desde la recolección de muestras hasta la secuenciación. Se han evaluado protocolos alternativos que podrían permitir un mayor rendimiento en dos de estos pasos: muestreo de campo y extracción de ADN. En este trabajo se compararon dos métodos distintos de conservación de las muestras obtenidas en el campo y siete métodos de extracción de ADN para heces de lobos (Canis lupus). Se observó una gran variación en el éxito de genotipado según los protocolos que se sigan. El método de muestreo de campo basado en frotado superficial de los excrementos dio resultados peores que la recolección de un fragmento del excremento. Por otro lado, los protocolos para la extracción de ADN mostraban resultados muy variables y ofrecen mucho margen de optimización y mejora. La optimización de protocolos puede llevar a un monitoreo no invasivo mucho más eficiente, económico y con mayor rendimiento. La selección de marcadores apropiados sigue siendo de importancia vital para incrementar el éxito de genotipado. informacion[at]ebd.csic.es: Sarabia et al (2020) Towards high-throughput analyses of fecal samples from wildlife. Animal Biodiver Conserv 43.2: 271–283 Doi 10.32800/abc.2020.43.0271


http://abc.museucienciesjournals.cat/volum-43-2-2020/towards-high-throughput-analyses-of-fecal-samples-from-wildlife/?lang=en
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Diferencias en la selección de microhábitats y materiales de nidificación entre tres aves que anidan en el suelo

Diferencias en la selección de microhábitats y materiales de nidificación entre tres aves que anidan en el suelo

El camuflaje es una estrategia generalizada para evitar la depredación y es de particular importancia para los animales con movilidad reducida o aquellos de hábitats expuestos. El camuflaje normalmente consiste en igualar el aspecto visual con el del fondo; seleccionar los fondos que complementan a escala fina la apariencia individual es una medida eficaz para optimizar el camuflaje. Utilizando modelos de visión aviar se investigó si existe una selección activa de microhábitats y materiales de nidificación para camuflar sus huevos en tres aves que anidan en el suelo (avoceta común, chorlitejo patinegro y charrancito común) . Los chorlitejos y avocetas seleccionaron sustratos en los que sus huevos estaban mejor camuflados, y esa selección se hizo a nivel individual. Los charrancitos tienen huevos más claros, menos moteados, y si bien seleccionaron un fondo más claro que las otras especies, sus huevos se parecen menos al entorno. Esta menor semejanza de los huevos del charrancito fue probablemente debida a un compromiso entre la protección térmica y el camuflaje, ya que se reproducen más tarde cuando las temperaturas son más altas. Finalmente, la aportación de materiales de nidos mejoró el camuflaje de los huevos en términos de iluminación, pero redujeron la coincidencia de patrones, lo que puede estar asociado con los diferentes roles que juegan los materiales del nido. La selección activa de sustratos a nivel individual puede ser crucial para mejorar el éxito de nidificación en especies que anidan en sitios expuestos. informacion[at]ebd.csic.es: Gómez et al (2018) Individual egg camouflage is influenced by microhabitat selection and use of nest materials in ground-nesting birds. Behav Ecol Sociobiol 72:142 https://doi.org/10.1007/s00265-018-2558-7

 


https://link.springer.com/article/10.1007%2Fs00265-018-2558-7