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La optimización de protocolos para la extracción de ADN de muestras fecales

La secuenciación de alto rendimiento ofrece nuevas posibilidades en ecología molecular y biología de la conservación. Sin embargo, el potencial de esta técnica no ha sido totalmente explotado para estudios no invasivos, a partir de muestras fecales, de fauna silvestre. La secuenciación de alto rendimiento permite la secuenciación de fragmentos de ADN cortos y podría permitir el genotipado simultáneo de un gran número de muestras y marcadores a un bajo coste. La aplicación de estas técnicas a muestras fecales de fauna silvestre ha sido obstaculizada por la gran cantidad de trabajo requerido en varios pasos, desde la recolección de muestras hasta la secuenciación. Se han evaluado protocolos alternativos que podrían permitir un mayor rendimiento en dos de estos pasos: muestreo de campo y extracción de ADN. En este trabajo se compararon dos métodos distintos de conservación de las muestras obtenidas en el campo y siete métodos de extracción de ADN para heces de lobos (Canis lupus). Se observó una gran variación en el éxito de genotipado según los protocolos que se sigan. El método de muestreo de campo basado en frotado superficial de los excrementos dio resultados peores que la recolección de un fragmento del excremento. Por otro lado, los protocolos para la extracción de ADN mostraban resultados muy variables y ofrecen mucho margen de optimización y mejora. La optimización de protocolos puede llevar a un monitoreo no invasivo mucho más eficiente, económico y con mayor rendimiento. La selección de marcadores apropiados sigue siendo de importancia vital para incrementar el éxito de genotipado. informacion[at]ebd.csic.es: Sarabia et al (2020) Towards high-throughput analyses of fecal samples from wildlife. Animal Biodiver Conserv 43.2: 271–283 Doi 10.32800/abc.2020.43.0271


http://abc.museucienciesjournals.cat/volum-43-2-2020/towards-high-throughput-analyses-of-fecal-samples-from-wildlife/?lang=en
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Diferentes respuestas al cambio climático en aves residentes y migradoras

Diferentes respuestas al cambio climático en aves residentes y migradoras

Se estudió el ajuste al cambio climático y los efectos diferenciales de la temperatura en aves residentes y migratorias usando las fechas de comienzo de las puestas en diez estudios a largo plazo en cajas nido con datos sobre al menos una especie de Párido residente y una especie migradora de papamoscas.  Los páridos residentes avanzaron su cría más acusadamente en relación con los aumentos de temperatura que los papamoscas migradores. La divergencia fue más fuerte en las latitudes más bajas, donde el intervalo entre páridos y papamoscas es más pequeño y las condiciones invernales más favorables para las aves residentes. El ajuste fenológico de los papamoscas al cambio climático parece verse progresivamente más obstaculizado por la competencia con las especies residentes. El efecto diferencial del cambio climático en grupos de especies con ecología reproductiva superpuesta  afecta el intervalo fenológico entre ellas, afectando a las interacciones interespecíficas.  informacion[at]ebd.csic.es Samplonius et al. (2018) Phenological sensitivity to climate change is higher in resident than in migrant bird populations among European cavity breeders; Global Change Biol https://doi.org/10.1111/gcb.14160 


https://onlinelibrary.wiley.com/doi/epdf/10.1111/gcb.14160