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La optimización de protocolos para la extracción de ADN de muestras fecales

La secuenciación de alto rendimiento ofrece nuevas posibilidades en ecología molecular y biología de la conservación. Sin embargo, el potencial de esta técnica no ha sido totalmente explotado para estudios no invasivos, a partir de muestras fecales, de fauna silvestre. La secuenciación de alto rendimiento permite la secuenciación de fragmentos de ADN cortos y podría permitir el genotipado simultáneo de un gran número de muestras y marcadores a un bajo coste. La aplicación de estas técnicas a muestras fecales de fauna silvestre ha sido obstaculizada por la gran cantidad de trabajo requerido en varios pasos, desde la recolección de muestras hasta la secuenciación. Se han evaluado protocolos alternativos que podrían permitir un mayor rendimiento en dos de estos pasos: muestreo de campo y extracción de ADN. En este trabajo se compararon dos métodos distintos de conservación de las muestras obtenidas en el campo y siete métodos de extracción de ADN para heces de lobos (Canis lupus). Se observó una gran variación en el éxito de genotipado según los protocolos que se sigan. El método de muestreo de campo basado en frotado superficial de los excrementos dio resultados peores que la recolección de un fragmento del excremento. Por otro lado, los protocolos para la extracción de ADN mostraban resultados muy variables y ofrecen mucho margen de optimización y mejora. La optimización de protocolos puede llevar a un monitoreo no invasivo mucho más eficiente, económico y con mayor rendimiento. La selección de marcadores apropiados sigue siendo de importancia vital para incrementar el éxito de genotipado. informacion[at]ebd.csic.es: Sarabia et al (2020) Towards high-throughput analyses of fecal samples from wildlife. Animal Biodiver Conserv 43.2: 271–283 Doi 10.32800/abc.2020.43.0271


http://abc.museucienciesjournals.cat/volum-43-2-2020/towards-high-throughput-analyses-of-fecal-samples-from-wildlife/?lang=en
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Dinámica de población de la liebre en Doñana

Dinámica de población de la liebre en Doñana

La liebre ibérica (Lepus granatensis) es una especie endémica de la Península Ibérica. Durante el periodo 1995-2012 se ha estudiado la abundancia relativa de la especie y su tendencia poblacional en el Parque Nacional de Doñana mediante censos nocturnos en dos hábitats diferentes: marisma y Vera. El índice de abundancia relativa fue 0.38 liebres/Km (SD: 0.63) en la marisma y 3.6 liebres/Km (SD: 4.09) en la Vera. La liebre ibérica muestra fluctuaciones anuales locales y una tendencia poblacional negativa durante el periodo de estudio sugiriendo que la población se encuentra en declive. Las inundaciones de parte de la marisma en junio, julio y octubre favorecen la abundancia de la especie en la Vera. En la marisma, ésta se incrementa con el aumento de la superficie inundada en octubre. Estos efectos son más pronunciados si las lluvias son tempranas y correlacionadas con las inundaciones en el mes de marzo. Por el contrario cuando la superficie de gramíneas y graminoides son elevadas y densas la abundancia de liebres decrece dramáticamente ayudado por la superficie inundada de marisma en noviembre. información: [at]ebd.csic.es: Carro & Soriguer (2017) Long-term patterns in Iberian hare population dynamics in a protected area (Doñana National Park) in the SW Iberian Peninsula: effects of wheather conditions and plant cover. Integr Zool DOI: 10.1111/1749-4877.1221


http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/1749-4877.12212/abstract