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La optimización de protocolos para la extracción de ADN de muestras fecales

La secuenciación de alto rendimiento ofrece nuevas posibilidades en ecología molecular y biología de la conservación. Sin embargo, el potencial de esta técnica no ha sido totalmente explotado para estudios no invasivos, a partir de muestras fecales, de fauna silvestre. La secuenciación de alto rendimiento permite la secuenciación de fragmentos de ADN cortos y podría permitir el genotipado simultáneo de un gran número de muestras y marcadores a un bajo coste. La aplicación de estas técnicas a muestras fecales de fauna silvestre ha sido obstaculizada por la gran cantidad de trabajo requerido en varios pasos, desde la recolección de muestras hasta la secuenciación. Se han evaluado protocolos alternativos que podrían permitir un mayor rendimiento en dos de estos pasos: muestreo de campo y extracción de ADN. En este trabajo se compararon dos métodos distintos de conservación de las muestras obtenidas en el campo y siete métodos de extracción de ADN para heces de lobos (Canis lupus). Se observó una gran variación en el éxito de genotipado según los protocolos que se sigan. El método de muestreo de campo basado en frotado superficial de los excrementos dio resultados peores que la recolección de un fragmento del excremento. Por otro lado, los protocolos para la extracción de ADN mostraban resultados muy variables y ofrecen mucho margen de optimización y mejora. La optimización de protocolos puede llevar a un monitoreo no invasivo mucho más eficiente, económico y con mayor rendimiento. La selección de marcadores apropiados sigue siendo de importancia vital para incrementar el éxito de genotipado. informacion[at]ebd.csic.es: Sarabia et al (2020) Towards high-throughput analyses of fecal samples from wildlife. Animal Biodiver Conserv 43.2: 271–283 Doi 10.32800/abc.2020.43.0271


http://abc.museucienciesjournals.cat/volum-43-2-2020/towards-high-throughput-analyses-of-fecal-samples-from-wildlife/?lang=en
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Efectos de la reducción del tamaño de los dispersores de semillas en el reclutamiento temprano de plantas

Efectos de la reducción del tamaño de los dispersores de semillas en el reclutamiento temprano de plantas

La reducción del tamaño de los vertebrados frugívoros mediada por la acción humana puede conllevar una pérdida de la calidad de los servicios de dispersión de semillas que éstos ofrecen. Como consecuencia, la regeneración y la dinámica de las poblaciones de plantas que dependen de ellos pueden verse afectadas negativamente. En este trabajo se evalúan las consecuencias de la extinción y reducción del tamaño corporal de los lagartos gigantes de Canarias (g. Gallotia, Lacertidae) en la regeneración natural de Neochamaelea pulverulenta (Rutaceae), un arbusto endémico de las islas que depende exclusivamente de los lagartos para dispersar sus semillas. Los resultados no muestran diferencias en los patrones de estructura de edad (componente cuantitativa), pero sí una reducción significativa de la tasa de reclutamiento efectiva y del vigor de las plántulas (componente cualitativa) en las poblaciones que albergan lagartos de tamaño medio y pequeño cuando lo comparamos con las que presentan lagartos grandes. Este trabajo resalta la importancia de conservar todo el rango de procesos funcionales (componente cuantitativa y cualitativa) envueltos en las relaciones mutualistas para mantener la regeneración y dinámica poblacional. informacion[at]ebd.csic.es Pérez-Méndez et al (2015).  Downsized mutualisms: Consequences of seed dispersers' body-size reduction for early plant recruitment. Perspect Plant Ecol Evol Syst DOI: 10.1016/j.ppees.2014.12.001