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La optimización de protocolos para la extracción de ADN de muestras fecales

La secuenciación de alto rendimiento ofrece nuevas posibilidades en ecología molecular y biología de la conservación. Sin embargo, el potencial de esta técnica no ha sido totalmente explotado para estudios no invasivos, a partir de muestras fecales, de fauna silvestre. La secuenciación de alto rendimiento permite la secuenciación de fragmentos de ADN cortos y podría permitir el genotipado simultáneo de un gran número de muestras y marcadores a un bajo coste. La aplicación de estas técnicas a muestras fecales de fauna silvestre ha sido obstaculizada por la gran cantidad de trabajo requerido en varios pasos, desde la recolección de muestras hasta la secuenciación. Se han evaluado protocolos alternativos que podrían permitir un mayor rendimiento en dos de estos pasos: muestreo de campo y extracción de ADN. En este trabajo se compararon dos métodos distintos de conservación de las muestras obtenidas en el campo y siete métodos de extracción de ADN para heces de lobos (Canis lupus). Se observó una gran variación en el éxito de genotipado según los protocolos que se sigan. El método de muestreo de campo basado en frotado superficial de los excrementos dio resultados peores que la recolección de un fragmento del excremento. Por otro lado, los protocolos para la extracción de ADN mostraban resultados muy variables y ofrecen mucho margen de optimización y mejora. La optimización de protocolos puede llevar a un monitoreo no invasivo mucho más eficiente, económico y con mayor rendimiento. La selección de marcadores apropiados sigue siendo de importancia vital para incrementar el éxito de genotipado. informacion[at]ebd.csic.es: Sarabia et al (2020) Towards high-throughput analyses of fecal samples from wildlife. Animal Biodiver Conserv 43.2: 271–283 Doi 10.32800/abc.2020.43.0271


http://abc.museucienciesjournals.cat/volum-43-2-2020/towards-high-throughput-analyses-of-fecal-samples-from-wildlife/?lang=en
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El cangrejo autóctono no es autóctono

El cangrejo autóctono no es autóctono

En España llamamos cangrejo de río autóctono a una especie (Austropotamobius italicus) que fue abundante en los ríos y las mesas del país hasta que sus poblaciones se derrumbaron tras la llegada de dos especies de cangrejos norteamericanos. Pero todas las evidencias nos dicen que no existe en la península ibérica ningún cangrejo de río autóctono. Un estudio ha puesto de manifiesto que el cangrejo autóctono es en realidad una especie importada desde Italia a finales del siglo XVI. El trabajo ahora publicado integra evidencias provenientes de múltiples áreas de conocimiento. Un equipo multidisciplinar ha recopilado información histórica, ecológica y biogeográfica, arqueológica y paleontológica, sobre usos lingüísticos y gastronómicos, sobre presencias y ausencias de parásitos y sobre genética para concluir que la única explicación razonable para la presencia del cangrejo de río en España es que haya sido introducido desde Italia. El estudio llega a poner fecha a la introducción: los cangrejos de río fueron traídos a España en 1588 como regalo del gran duque de la Toscana a Felipe II. El trabajo propone que la evidencia de que el cangrejo de río es una especie introducida debería llevar al replanteamiento de las estrategias españolas de conservación de la biodiversidad, en las que la recuperación de la especie es una de las principales prioridades. informacion[at]ebd.csic.es: Clavero et al (2015) Interdisciplinarity to reconstruct historical introductions: solving the status of cryptogenic crayfish. Biol Rev DOI: 10.1111/brv.12205


http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/brv.12205/abstract