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La optimización de protocolos para la extracción de ADN de muestras fecales

La secuenciación de alto rendimiento ofrece nuevas posibilidades en ecología molecular y biología de la conservación. Sin embargo, el potencial de esta técnica no ha sido totalmente explotado para estudios no invasivos, a partir de muestras fecales, de fauna silvestre. La secuenciación de alto rendimiento permite la secuenciación de fragmentos de ADN cortos y podría permitir el genotipado simultáneo de un gran número de muestras y marcadores a un bajo coste. La aplicación de estas técnicas a muestras fecales de fauna silvestre ha sido obstaculizada por la gran cantidad de trabajo requerido en varios pasos, desde la recolección de muestras hasta la secuenciación. Se han evaluado protocolos alternativos que podrían permitir un mayor rendimiento en dos de estos pasos: muestreo de campo y extracción de ADN. En este trabajo se compararon dos métodos distintos de conservación de las muestras obtenidas en el campo y siete métodos de extracción de ADN para heces de lobos (Canis lupus). Se observó una gran variación en el éxito de genotipado según los protocolos que se sigan. El método de muestreo de campo basado en frotado superficial de los excrementos dio resultados peores que la recolección de un fragmento del excremento. Por otro lado, los protocolos para la extracción de ADN mostraban resultados muy variables y ofrecen mucho margen de optimización y mejora. La optimización de protocolos puede llevar a un monitoreo no invasivo mucho más eficiente, económico y con mayor rendimiento. La selección de marcadores apropiados sigue siendo de importancia vital para incrementar el éxito de genotipado. informacion[at]ebd.csic.es: Sarabia et al (2020) Towards high-throughput analyses of fecal samples from wildlife. Animal Biodiver Conserv 43.2: 271–283 Doi 10.32800/abc.2020.43.0271


http://abc.museucienciesjournals.cat/volum-43-2-2020/towards-high-throughput-analyses-of-fecal-samples-from-wildlife/?lang=en
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Especies endémicas subrepresentadas en la Directiva Hábitat

Especies endémicas subrepresentadas en la Directiva Hábitat

La Península Ibérica es una importante región europea de biodiversidad, ya que alberga más del 30% de las especies endémicas europeas. A pesar de que varios estudios hayan evaluado la capacidad de las reservas naturales para proteger ciertos taxones, aún hay una falta de conocimiento sobre cómo la fauna endémica ibérica está representada en estas reservas. Aquí se revisaron los puntos calientes de biodiversidad de los endemismos ibéricos y se evaluó la efectividad de la Red Natura 2000 (N2000) en representar 249 especies endémicas de ocho grupos taxonómicos de animales (anfibios, mamíferos, peces de agua dulce, reptiles, escarabajos de agua, mariposas, crisopas y escarabajos peloteros). Solo el 10% de estas especies endémicas se consideran especies de interés comunitario (es decir, especies incluidas en los anexos de la Directiva Hábitat). En general, la N2000 es eficaz en su representación de la fauna endémica ibérica, aunque faltan varias especies y puntos calientes de endemismo. Es necesario declarar algunas áreas protegidas nuevas, mejorando así la efectividad de la N2000 en la conservación de la fauna endémica ibérica. Aunque el objetivo de la N2000 es proteger especies incluidas en las Directivas de Aves y Hábitats, el estado de conservación de las especies endémicas de una de las áreas más importantes de Europa en términos de biodiversidad podría ser también una preocupación para la Unión Europea. Estos resultados son útiles en el contexto del reciente mandato de la Comisión Europea que exige una "revisión de la idoneidad" de las Directivas Aves y Hábitat. Este enfoque también podría aplicarse a otras regiones con alto valor por endemismos. informacion[at]ebd.csic.es Rosso et al (2017) Effectiveness of the Natura 2000 network in protecting Iberian endemic fauna. Anim Conserv Doi 10.1111/acv.12387


http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/acv.12387/abstract