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La optimización de protocolos para la extracción de ADN de muestras fecales

La secuenciación de alto rendimiento ofrece nuevas posibilidades en ecología molecular y biología de la conservación. Sin embargo, el potencial de esta técnica no ha sido totalmente explotado para estudios no invasivos, a partir de muestras fecales, de fauna silvestre. La secuenciación de alto rendimiento permite la secuenciación de fragmentos de ADN cortos y podría permitir el genotipado simultáneo de un gran número de muestras y marcadores a un bajo coste. La aplicación de estas técnicas a muestras fecales de fauna silvestre ha sido obstaculizada por la gran cantidad de trabajo requerido en varios pasos, desde la recolección de muestras hasta la secuenciación. Se han evaluado protocolos alternativos que podrían permitir un mayor rendimiento en dos de estos pasos: muestreo de campo y extracción de ADN. En este trabajo se compararon dos métodos distintos de conservación de las muestras obtenidas en el campo y siete métodos de extracción de ADN para heces de lobos (Canis lupus). Se observó una gran variación en el éxito de genotipado según los protocolos que se sigan. El método de muestreo de campo basado en frotado superficial de los excrementos dio resultados peores que la recolección de un fragmento del excremento. Por otro lado, los protocolos para la extracción de ADN mostraban resultados muy variables y ofrecen mucho margen de optimización y mejora. La optimización de protocolos puede llevar a un monitoreo no invasivo mucho más eficiente, económico y con mayor rendimiento. La selección de marcadores apropiados sigue siendo de importancia vital para incrementar el éxito de genotipado. informacion[at]ebd.csic.es: Sarabia et al (2020) Towards high-throughput analyses of fecal samples from wildlife. Animal Biodiver Conserv 43.2: 271–283 Doi 10.32800/abc.2020.43.0271


http://abc.museucienciesjournals.cat/volum-43-2-2020/towards-high-throughput-analyses-of-fecal-samples-from-wildlife/?lang=en
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Inferencias sobre la paleobiología y la tafonomía de caballos fósiles a partir del estudio radiológico de sus mandíbulas

Inferencias sobre la paleobiología y la tafonomía de caballos fósiles a partir del estudio radiológico de sus mandíbulas

Los yacimientos paleontológicos del Cerro de los Batallones (Torrejón de Velasco, Comunidad de Madrid) son únicos a nivel mundial ya que contienen una riqueza excepcional de fósiles de mamíferos de hace 9 millones de años. El estado de conservación de los restos es extraordinario y está permitiendo a los paleontólogos que allí trabajan llevar a cabo análisis y descubrimientos únicos en el registro fósil. Aquí se muestra un ejemplo del tipo de análisis y descubrimientos que se están llevando a cabo en los fósiles de estos yacimientos . Paleontólogos y veterinarios han trabajado conjuntamente en la realización de radiografías y tomografías computerizadas en mandíbulas pertenecientes a 28 individuos del caballo del género Hipparion sp. procedente del yacimiento de Batallones-10. Se trata de la primera vez que este tipo de técnicas han sido aplicadas al estudio de caballos fósiles, un grupo de animales muy importante en el registro fósil debido a la abundancia y amplia distribución geográfica y temporal de sus fósiles. En este estudio se caracteriza la secuencia ontogenética dental de este caballo fósil describiendo los patrones de mineralización, erupción y reemplazo de los dientes yugales. Además, se ha determinado la presencia en el yacimiento de caballos pertenecientes a 7 clases de edad que van desde potros recién nacidos a individuos viejos pasando por individuos en edades intermedias. Los individuos infantiles y juveniles son los más abundantes en Batallones-10 (68%) y, entre los adultos, se confirma la presencia en el yacimiento de dos hembras embarazas a partir del hallazgo de los huesos fósiles de dos fetos excelentemente preservados. Todos estos animales se encuentran en grupos de mayor riesgo de muerte en poblaciones modernas. A partir de este estudio y otras evidencias registradas en el yacimiento de Batallones-10, los investigadores concluyen que se produjo la muerte gradual de individuos de distintas poblaciones de caballos, alrededor de un pequeño charco o punto de agua, sobre todo en períodos de escasez de recursos como en épocas de sequías. informacion[at]ebd.csic.es: Domingo et al (2018) First radiological study of a complete dental ontogeny sequence of an extinct equid: implications for Equidae life history and taphonomy. Sci Rep 8: 8507 https://doi.org/10.1038/s41598-018-26817-3


https://www.nature.com/articles/s41598-018-26817-3