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La optimización de protocolos para la extracción de ADN de muestras fecales

La secuenciación de alto rendimiento ofrece nuevas posibilidades en ecología molecular y biología de la conservación. Sin embargo, el potencial de esta técnica no ha sido totalmente explotado para estudios no invasivos, a partir de muestras fecales, de fauna silvestre. La secuenciación de alto rendimiento permite la secuenciación de fragmentos de ADN cortos y podría permitir el genotipado simultáneo de un gran número de muestras y marcadores a un bajo coste. La aplicación de estas técnicas a muestras fecales de fauna silvestre ha sido obstaculizada por la gran cantidad de trabajo requerido en varios pasos, desde la recolección de muestras hasta la secuenciación. Se han evaluado protocolos alternativos que podrían permitir un mayor rendimiento en dos de estos pasos: muestreo de campo y extracción de ADN. En este trabajo se compararon dos métodos distintos de conservación de las muestras obtenidas en el campo y siete métodos de extracción de ADN para heces de lobos (Canis lupus). Se observó una gran variación en el éxito de genotipado según los protocolos que se sigan. El método de muestreo de campo basado en frotado superficial de los excrementos dio resultados peores que la recolección de un fragmento del excremento. Por otro lado, los protocolos para la extracción de ADN mostraban resultados muy variables y ofrecen mucho margen de optimización y mejora. La optimización de protocolos puede llevar a un monitoreo no invasivo mucho más eficiente, económico y con mayor rendimiento. La selección de marcadores apropiados sigue siendo de importancia vital para incrementar el éxito de genotipado. informacion[at]ebd.csic.es: Sarabia et al (2020) Towards high-throughput analyses of fecal samples from wildlife. Animal Biodiver Conserv 43.2: 271–283 Doi 10.32800/abc.2020.43.0271


http://abc.museucienciesjournals.cat/volum-43-2-2020/towards-high-throughput-analyses-of-fecal-samples-from-wildlife/?lang=en
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La categoría de amenaza del lince ibérico se reduce en la Lista Roja de la IUCN

La categoría de amenaza del lince ibérico se reduce en la Lista Roja de la IUCN

Tras seis décadas de declive y marcada reducción de su área de distribución, entre 2002 y 2012 la población de lince ibérico ha pasado de 52 a 156 individuos reproductores distribuidos en dos poblaciones silvestres. El tamaño del área ocupada también se ha triplicado hasta alcanzar los 1040 km2. Sierra Morena oriental alberga el 68% de la población total. En 2012 doce individuos adultos ocupaban otras dos localidades de Sierra Morena oriental donde se están llevando a cabo reintroducciones y donde, desde entonces, la tendencia en el tamaño de población sigue siendo positiva. Como consecuencia de estos cambios, la categoría de amenaza del lince ibérico en la Lista Roja de la UICN ha cambiado de "Críticamente Amenazada" a "Amenazada", de acuerdo con el criterio D. Los resultados de modelos demográficos que incorporan gran realismo biológico sugieren que mantener esta tendencia positiva en el futuro depende estrictamente de continuar con las reintroducciones. En ausencia de reintroducciones los modelos predicen la extinción del lince ibérico en aproximadamente 35 años. Las amenazas más importantes que pesan sobre la conservación de este felino son la incertidumbre sobre la naturaleza e intensidad de los agentes que determinan la abundancia de sus presas y, especialmente, la respuesta de estas ante el cambio climático. informacion[at]ebd.csic.es Rodríguez, A. & Calzada, J. 2015. Lynx pardinus. The IUCN Red List of Threatened Species. Version 2015.2 http://www.iucnredlist.org/details/12520/0


http://www.iucnredlist.org/details/12520/0