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La optimización de protocolos para la extracción de ADN de muestras fecales

La secuenciación de alto rendimiento ofrece nuevas posibilidades en ecología molecular y biología de la conservación. Sin embargo, el potencial de esta técnica no ha sido totalmente explotado para estudios no invasivos, a partir de muestras fecales, de fauna silvestre. La secuenciación de alto rendimiento permite la secuenciación de fragmentos de ADN cortos y podría permitir el genotipado simultáneo de un gran número de muestras y marcadores a un bajo coste. La aplicación de estas técnicas a muestras fecales de fauna silvestre ha sido obstaculizada por la gran cantidad de trabajo requerido en varios pasos, desde la recolección de muestras hasta la secuenciación. Se han evaluado protocolos alternativos que podrían permitir un mayor rendimiento en dos de estos pasos: muestreo de campo y extracción de ADN. En este trabajo se compararon dos métodos distintos de conservación de las muestras obtenidas en el campo y siete métodos de extracción de ADN para heces de lobos (Canis lupus). Se observó una gran variación en el éxito de genotipado según los protocolos que se sigan. El método de muestreo de campo basado en frotado superficial de los excrementos dio resultados peores que la recolección de un fragmento del excremento. Por otro lado, los protocolos para la extracción de ADN mostraban resultados muy variables y ofrecen mucho margen de optimización y mejora. La optimización de protocolos puede llevar a un monitoreo no invasivo mucho más eficiente, económico y con mayor rendimiento. La selección de marcadores apropiados sigue siendo de importancia vital para incrementar el éxito de genotipado. informacion[at]ebd.csic.es: Sarabia et al (2020) Towards high-throughput analyses of fecal samples from wildlife. Animal Biodiver Conserv 43.2: 271–283 Doi 10.32800/abc.2020.43.0271


http://abc.museucienciesjournals.cat/volum-43-2-2020/towards-high-throughput-analyses-of-fecal-samples-from-wildlife/?lang=en
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La especie invasora Trichocorixa verticalis presenta una respuesta inmune a la infección por parásitos más débil que las especies nativas

La especie invasora Trichocorixa verticalis presenta una respuesta inmune a la infección por parásitos más débil que las especies nativas

Este estudio analiza la respuesta inmune de los barqueros de agua, insectos de la familia corixidae, al ectoparasitismo por ácaros acuáticos con el objetivo de determinar sus implicaciones en la competencia y en la invasión de la especie exótica Trichocorixa verticalis. Los resultados obtenidos podrían ayudar a entender por qué la especie invasora vive preferentemente en los humedales salinos y menos en aguas dulces. Trichocorixa verticalis mostró los valores basales más bajos de respuesta inmune de entre todas las especies de coríxidos estudiadas. En condiciones de alta salinidad, donde los parásitos son escasos, invertir en defensa inmune no sería ventajoso, ya que ésta resulta costosa para el huésped. Es decir, los resultados de este estudio ayudan a explicar por qué Trichocorixa verticalis tiene una preferencia por aguas salinas dónde el ectoparasitismo es menos importante. Para el estudio, se recolectaron los barqueros de agua, concretamente Sigara lateralis, S. scripta, S. stagnalis, Corixa affinis y la invasora Trichocorixa verticalis. Se tomaron tanto ejemplares sanos como infectados por los ectoparásitos de las especies Hydrachna skorikowi y Eylais infundibulifera y se realizaron infecciones controladas en el laboratorio para excluir otros factores estresantes que podrían afectar a la respuesta inmune. Se determinó que las infecciones por ácaros disminuyen la función inmune de los tres géneros estudiados Sigara, Corixa y Trichocorixa, pero en mucho mayor medida para el caso de la especie invasora. Los resultados de esta investigación proporcionan uno de los pocos ejemplos en los que los parásitos suprimen al huésped invasor en mayor grado que a las especies nativas, lo que sugiere una desventaja competitiva para el invasor. informacion[at]ebd.csic.es: Céspedes et al (2019) Eco-immunology of native and invasive water bugs in response to water mite parasites: insights from phenoloxidase activity. Biol Invasions https://doi.org/10.1007/s10530-019-01988-w


https://link.springer.com/article/10.1007/s10530-019-01988-w