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La optimización de protocolos para la extracción de ADN de muestras fecales

La secuenciación de alto rendimiento ofrece nuevas posibilidades en ecología molecular y biología de la conservación. Sin embargo, el potencial de esta técnica no ha sido totalmente explotado para estudios no invasivos, a partir de muestras fecales, de fauna silvestre. La secuenciación de alto rendimiento permite la secuenciación de fragmentos de ADN cortos y podría permitir el genotipado simultáneo de un gran número de muestras y marcadores a un bajo coste. La aplicación de estas técnicas a muestras fecales de fauna silvestre ha sido obstaculizada por la gran cantidad de trabajo requerido en varios pasos, desde la recolección de muestras hasta la secuenciación. Se han evaluado protocolos alternativos que podrían permitir un mayor rendimiento en dos de estos pasos: muestreo de campo y extracción de ADN. En este trabajo se compararon dos métodos distintos de conservación de las muestras obtenidas en el campo y siete métodos de extracción de ADN para heces de lobos (Canis lupus). Se observó una gran variación en el éxito de genotipado según los protocolos que se sigan. El método de muestreo de campo basado en frotado superficial de los excrementos dio resultados peores que la recolección de un fragmento del excremento. Por otro lado, los protocolos para la extracción de ADN mostraban resultados muy variables y ofrecen mucho margen de optimización y mejora. La optimización de protocolos puede llevar a un monitoreo no invasivo mucho más eficiente, económico y con mayor rendimiento. La selección de marcadores apropiados sigue siendo de importancia vital para incrementar el éxito de genotipado. informacion[at]ebd.csic.es: Sarabia et al (2020) Towards high-throughput analyses of fecal samples from wildlife. Animal Biodiver Conserv 43.2: 271–283 Doi 10.32800/abc.2020.43.0271


http://abc.museucienciesjournals.cat/volum-43-2-2020/towards-high-throughput-analyses-of-fecal-samples-from-wildlife/?lang=en
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La liberalización de la Política Agrícola Común afectará al buitre negro

La liberalización de la Política Agrícola Común afectará al buitre negro

La liberalización de la Política Agrícola Común (PAC), un programa de la Unión Europea que pretende garantizar a los agricultores un nivel de vida razonable mediante la concesión de ayudas, mejora de la productividad, apoyo en el mercado y desarrollo rural, podrá afectar a la distribución del buitre negro, una especie carroñera que está fuertemente ligada al ecosistema mediterráneo. El estudio se centra en el empleo de diferentes modelos socioeconómicos de previsión de abandono de tierras para evaluar cómo se verá afectada la distribución de esta especie en 2040. Los resultados indican que el principal factor de cambio es la posibilidad de liberalización de la Política Agrícola Común. La liberación de la PAC supondría una reducción de las ayudas y subvenciones a agricultores, y esto conllevaría un aumento del abandono de tierras y una sucesión natural de la vegetación (rewilding). En esta situación, las tierras abandonadas se transformarían con el tiempo en bosques maduros, lo que beneficiaría el hábitat de cría del buitre negro, pero quedaría afectado su hábitat de forrajeo, es decir, la probabilidad de conseguir alimento, ya que el conejo, importante en su dieta, estaría menos disponible en este tipo de hábitat. El mantenimiento de la PAC en la línea actual no provocaría el abandono de tantas tierras ya que se mantendrían las ayudas. Sin embargo, hay otros factores, como los incendios forestales, que también pueden afectar al hábitat de cría del buitre negro. Aunque el buitre negro viera afectado su hábitat de forrajeo con la proliferación del bosque maduro, sus movimientos amplios le permitirían recorrer grandes distancias para conseguir alimento. También los incendios forestales aumentarían la presencia del conejo, al existir más zonas libres. A pesar de eso, los modelos dicen que el cambio de la PAC será crucial para ver cambios en el paisaje que afecten al buitre negro. Por otra parte, aunque según los modelos nuevas áreas se vuelvan aptas para albergar estas especies, es probable que la colonización no ocurra a corto o medio plazo. El trabajo es de gran importancia ya que es la primera vez que se hace este tipo de estudios con una especie carroñera y amenazada. informacion[at]ebd.csic.es García-Barón et al (2018) How to fit the distribution of apex scavengers into land-abandonment scenarios? The Cinereous vulture in the Mediterranean biome. Divers Distrib https://doi.org/10.1111/ddi.12743


https://onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1111/ddi.12743