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La optimización de protocolos para la extracción de ADN de muestras fecales

La secuenciación de alto rendimiento ofrece nuevas posibilidades en ecología molecular y biología de la conservación. Sin embargo, el potencial de esta técnica no ha sido totalmente explotado para estudios no invasivos, a partir de muestras fecales, de fauna silvestre. La secuenciación de alto rendimiento permite la secuenciación de fragmentos de ADN cortos y podría permitir el genotipado simultáneo de un gran número de muestras y marcadores a un bajo coste. La aplicación de estas técnicas a muestras fecales de fauna silvestre ha sido obstaculizada por la gran cantidad de trabajo requerido en varios pasos, desde la recolección de muestras hasta la secuenciación. Se han evaluado protocolos alternativos que podrían permitir un mayor rendimiento en dos de estos pasos: muestreo de campo y extracción de ADN. En este trabajo se compararon dos métodos distintos de conservación de las muestras obtenidas en el campo y siete métodos de extracción de ADN para heces de lobos (Canis lupus). Se observó una gran variación en el éxito de genotipado según los protocolos que se sigan. El método de muestreo de campo basado en frotado superficial de los excrementos dio resultados peores que la recolección de un fragmento del excremento. Por otro lado, los protocolos para la extracción de ADN mostraban resultados muy variables y ofrecen mucho margen de optimización y mejora. La optimización de protocolos puede llevar a un monitoreo no invasivo mucho más eficiente, económico y con mayor rendimiento. La selección de marcadores apropiados sigue siendo de importancia vital para incrementar el éxito de genotipado. informacion[at]ebd.csic.es: Sarabia et al (2020) Towards high-throughput analyses of fecal samples from wildlife. Animal Biodiver Conserv 43.2: 271–283 Doi 10.32800/abc.2020.43.0271


http://abc.museucienciesjournals.cat/volum-43-2-2020/towards-high-throughput-analyses-of-fecal-samples-from-wildlife/?lang=en
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Las barreras de dispersión en un mundo cambiante

Las barreras de dispersión en un mundo cambiante

Las barreras de dispersión juegan un papel importante en muchos procesos ecológicos (p.ej. viabilidad poblacional, especiación). Por su naturaleza dinámica, pueden variar en intensidad y localización, y pueden verse afectadas por la intervención humana y por variaciones ambientales. Sin embargo, las barreras de dispersión rara vez se tienen en cuenta de manera explícita en los estudios de cambio global. Es importante poder predecir dónde van a aparecer o desaparecer, evaluar su impacto en la distribución de las especies y el flujo de genes, y gestionar las especies o  los espacios para mitigar sus impactos. Para ayudar a mantener la capacidad de adaptación de las especies cuando las barreras cambian se necesitan desarrollar opciones de manejo que tienen en cuenta la genética de poblaciones. informacion[at]ebd.csic.es:Caplat et al (2016) Looking beyond the mountain: dispersal barriers in a changing world. Front Ecol Environ 2016; 14(5): 261–268, doi:10.1002/fee.1280


http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/fee.1280/full