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La optimización de protocolos para la extracción de ADN de muestras fecales

La secuenciación de alto rendimiento ofrece nuevas posibilidades en ecología molecular y biología de la conservación. Sin embargo, el potencial de esta técnica no ha sido totalmente explotado para estudios no invasivos, a partir de muestras fecales, de fauna silvestre. La secuenciación de alto rendimiento permite la secuenciación de fragmentos de ADN cortos y podría permitir el genotipado simultáneo de un gran número de muestras y marcadores a un bajo coste. La aplicación de estas técnicas a muestras fecales de fauna silvestre ha sido obstaculizada por la gran cantidad de trabajo requerido en varios pasos, desde la recolección de muestras hasta la secuenciación. Se han evaluado protocolos alternativos que podrían permitir un mayor rendimiento en dos de estos pasos: muestreo de campo y extracción de ADN. En este trabajo se compararon dos métodos distintos de conservación de las muestras obtenidas en el campo y siete métodos de extracción de ADN para heces de lobos (Canis lupus). Se observó una gran variación en el éxito de genotipado según los protocolos que se sigan. El método de muestreo de campo basado en frotado superficial de los excrementos dio resultados peores que la recolección de un fragmento del excremento. Por otro lado, los protocolos para la extracción de ADN mostraban resultados muy variables y ofrecen mucho margen de optimización y mejora. La optimización de protocolos puede llevar a un monitoreo no invasivo mucho más eficiente, económico y con mayor rendimiento. La selección de marcadores apropiados sigue siendo de importancia vital para incrementar el éxito de genotipado. informacion[at]ebd.csic.es: Sarabia et al (2020) Towards high-throughput analyses of fecal samples from wildlife. Animal Biodiver Conserv 43.2: 271–283 Doi 10.32800/abc.2020.43.0271


http://abc.museucienciesjournals.cat/volum-43-2-2020/towards-high-throughput-analyses-of-fecal-samples-from-wildlife/?lang=en
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Los halcones gerifaltes Falco rusticolus ajustan la expresión de CTNS a la abundancia de alimento: una posible contribución a la homeostasis de cisteína

Los halcones gerifaltes Falco rusticolus ajustan la expresión de CTNS a la abundancia de alimento: una posible contribución a la homeostasis de cisteína

Las melaninas forman la base de la pigmentación animal. Cuando la forma sulfurada de melanina, denominada feomelanina, es sintetizada, el grupo sulfhidrilo de la cisteína es incorporado en la estructura del pigmento. Esto puede limitar el funcionamiento fisiológico porque consume el antioxidante intracelular más importante (i.e., glutatión, GSH), del que la cisteína es un aminoácido constituyente. Sin embargo, esto también puede ayudar a evitar el exceso de cisteína, que es tóxico. La síntesis de feomelanina es regulada por diferentes genes, algunos de ellos ejerciendo esta regulación controlando el transporte de cisteína en los melanocitos. Se ha investigado la posibilidad de que estos genes sean epigenéticamente lábiles en relación a la ingesta de proteínas y contribuyan así a la homeostasis de cisteína. En la población islandesa de halcón gerifalte Falco rusticolus, una especie que pigmenta su plumaje con feomelanina, se encontró que la expresión de un gen que regula la salida de cistina de los melanosomas (CTNS) en melanocitos de plumas de pollos en desarrollo aumenta con la abundancia de alimento en los territorios de reproducción en los que crecieron. La expresión de otros genes que regulan la síntesis de feomelanina mediante diferentes mecanismos de influencia en la disponibilidad de cisteína (Slc7a11 and Slc45a2) o a través de otros procesos (MC1R and AGRP) no fue afectada por la abundancia de alimento. Como el halcón gerifalte es un carnívoro estricto y la variación en la abundancia de alimento refleja principalmente variación en la ingesta de proteínas, los autores sugieren que la labilidad epigenética en CTNS ha evolucionado en algunas especies debido a sus potenciales beneficios contribuyendo a la homeostasis de cisteína. Potenciales aplicaciones de los resultados deberían ser investigados en el contexto de fallo renal y otros trastornos asociados a cistinosis causada por la disfunción de CTNS. informacion[at]ebd.csic.es: Galván et al (2017) Gyrfalcons Falco rusticolus adjust CTNS expression to food abundance: a possible contribution to cysteine homeostasis. OECOLOGIA Doi 10.1007/s00442-017-3920-6


https://link.springer.com/article/10.1007/s00442-017-3920-6