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La optimización de protocolos para la extracción de ADN de muestras fecales

La secuenciación de alto rendimiento ofrece nuevas posibilidades en ecología molecular y biología de la conservación. Sin embargo, el potencial de esta técnica no ha sido totalmente explotado para estudios no invasivos, a partir de muestras fecales, de fauna silvestre. La secuenciación de alto rendimiento permite la secuenciación de fragmentos de ADN cortos y podría permitir el genotipado simultáneo de un gran número de muestras y marcadores a un bajo coste. La aplicación de estas técnicas a muestras fecales de fauna silvestre ha sido obstaculizada por la gran cantidad de trabajo requerido en varios pasos, desde la recolección de muestras hasta la secuenciación. Se han evaluado protocolos alternativos que podrían permitir un mayor rendimiento en dos de estos pasos: muestreo de campo y extracción de ADN. En este trabajo se compararon dos métodos distintos de conservación de las muestras obtenidas en el campo y siete métodos de extracción de ADN para heces de lobos (Canis lupus). Se observó una gran variación en el éxito de genotipado según los protocolos que se sigan. El método de muestreo de campo basado en frotado superficial de los excrementos dio resultados peores que la recolección de un fragmento del excremento. Por otro lado, los protocolos para la extracción de ADN mostraban resultados muy variables y ofrecen mucho margen de optimización y mejora. La optimización de protocolos puede llevar a un monitoreo no invasivo mucho más eficiente, económico y con mayor rendimiento. La selección de marcadores apropiados sigue siendo de importancia vital para incrementar el éxito de genotipado. informacion[at]ebd.csic.es: Sarabia et al (2020) Towards high-throughput analyses of fecal samples from wildlife. Animal Biodiver Conserv 43.2: 271–283 Doi 10.32800/abc.2020.43.0271


http://abc.museucienciesjournals.cat/volum-43-2-2020/towards-high-throughput-analyses-of-fecal-samples-from-wildlife/?lang=en
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Metaanálisis global de los impactos de los invertebrados terrestres invasores sobre especies, comunidades y ecosistemas

Metaanálisis global de los impactos de los invertebrados terrestres invasores sobre especies, comunidades y ecosistemas

Los invertebrados terrestres suponen una gran proporción de las especies exóticas en todo el mundo, sin embargo falta una síntesis global cuantitativa de sus efectos sobre las especies nativas y los ecosistemas. En este estudio se ha llevado a cabo un metaanálisis para examinar los impactos ecológicos de los invertebrados terrestres invasores y para comprobar cómo estos impactos son modulados por la posición trófica de los invasores, las características del hábitat (insularidad y perturbación) y la metodología de estudio (observacional frente a experimental). Analizando 112 publicaciones con un conjunto de 710 estudios tanto de campo como de laboratorio, las principales conclusiones indican que los invertebrados terrestres invasores tienen efectos consistentes significativos sobre las poblaciones, comunidades y ecosistemas. Las islas y los sitios perturbados no son más propensos a los impactos. Sin embargo, los efectos varían considerablemente en función del tipo de impacto examinado y la posición trófica del invasor. No hay evidencia de que los invasores causen impactos mayores cuando varias especies invasoras están involucradas, en lugar de una sola. informacion [at]ebd.csic.es: Cameron et al (2016) Global meta-analysis of the impacts of terrestrial invertebrate invaders on species, communities and ecosystems. Global Ecol Biogeogr doi: 10.1111/geb.12436


http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/geb.12436/abstract