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La optimización de protocolos para la extracción de ADN de muestras fecales

La secuenciación de alto rendimiento ofrece nuevas posibilidades en ecología molecular y biología de la conservación. Sin embargo, el potencial de esta técnica no ha sido totalmente explotado para estudios no invasivos, a partir de muestras fecales, de fauna silvestre. La secuenciación de alto rendimiento permite la secuenciación de fragmentos de ADN cortos y podría permitir el genotipado simultáneo de un gran número de muestras y marcadores a un bajo coste. La aplicación de estas técnicas a muestras fecales de fauna silvestre ha sido obstaculizada por la gran cantidad de trabajo requerido en varios pasos, desde la recolección de muestras hasta la secuenciación. Se han evaluado protocolos alternativos que podrían permitir un mayor rendimiento en dos de estos pasos: muestreo de campo y extracción de ADN. En este trabajo se compararon dos métodos distintos de conservación de las muestras obtenidas en el campo y siete métodos de extracción de ADN para heces de lobos (Canis lupus). Se observó una gran variación en el éxito de genotipado según los protocolos que se sigan. El método de muestreo de campo basado en frotado superficial de los excrementos dio resultados peores que la recolección de un fragmento del excremento. Por otro lado, los protocolos para la extracción de ADN mostraban resultados muy variables y ofrecen mucho margen de optimización y mejora. La optimización de protocolos puede llevar a un monitoreo no invasivo mucho más eficiente, económico y con mayor rendimiento. La selección de marcadores apropiados sigue siendo de importancia vital para incrementar el éxito de genotipado. informacion[at]ebd.csic.es: Sarabia et al (2020) Towards high-throughput analyses of fecal samples from wildlife. Animal Biodiver Conserv 43.2: 271–283 Doi 10.32800/abc.2020.43.0271


http://abc.museucienciesjournals.cat/volum-43-2-2020/towards-high-throughput-analyses-of-fecal-samples-from-wildlife/?lang=en
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Segundo aviso: Científicos advierten sobre el aumento de las amenazas producidas por las especies exóticas invasoras

Segundo aviso: Científicos advierten sobre el aumento de las amenazas producidas por las especies exóticas invasoras

Científicos de todo el mundo advierten que las amenazas producidas por las especies exóticas invasoras están en aumento, sobrepasando las 18.000 en todo el mundo. Argumentan que se requieren medidas urgentes para prevenir, detectar y controlar a las especies invasoras a nivel local y global. Las especies exóticas son plantas, animales y microbios que se introducen por la gente, en forma accidental o intencionada, en un área en la que de forma natural no ocurren. Muchas de estos organismos prosperan, extendiendo ampliamente y causando daños en el ambiente, la economía, o la salud humana. La escalada de las invasiones biológicas se atribuye al aumento en el número y la variedad de las vías de entrada por las que las especies se expanden, y al aumento de volumen de tráfico asociado a estas vías de entrada y medios de transporte. Destaca el papel de las vías emergentes tales como el comercio en línea (on-line) de mascotas exóticas y el transporte de especies a través de océanos como polizones en materiales de plástico. El estudio también muestra cómo otros factores del cambio global, como el cambio climático, los cambios del uso del paisaje, junto con el comercio internacional están exacerbando los impactos de las invasiones biológicas. Por ejemplo, las especies transportadas a través del transporte marítimo ahora pueden prosperar en nuevas regiones, debido al calentamiento climático. Ya es una realidad que la apertura permanente del Océano Ártico por el calentamiento global está permitiendo el movimiento de especies marinas entre los océanos Atlántico y Pacífico. Las invasiones biológicas pueden ser gestionadas y mitigadas. Hay métodos que están funcionando en todo el mundo y existen recomendaciones específicas para mejorar la gestión de estas especies. Por ejemplo, la introducción de controles fronterizos más estrictos, incluidas las máquinas de rayos X y los perros detectores, ha llevado a una disminución progresiva en la tasa de hongos fitopatógenos que ingresan a Nueva Zelanda. informacion[at]ebd.csic.es: Pyšek et al (2020) Scientists' warning on invasive alien species. Biological Reviews. DOI 10.1111 / brv.12627


https://onlinelibrary.wiley.com/doi/full/10.1111/brv.12627