Noticias Noticias

La optimización de protocolos para la extracción de ADN de muestras fecales

La secuenciación de alto rendimiento ofrece nuevas posibilidades en ecología molecular y biología de la conservación. Sin embargo, el potencial de esta técnica no ha sido totalmente explotado para estudios no invasivos, a partir de muestras fecales, de fauna silvestre. La secuenciación de alto rendimiento permite la secuenciación de fragmentos de ADN cortos y podría permitir el genotipado simultáneo de un gran número de muestras y marcadores a un bajo coste. La aplicación de estas técnicas a muestras fecales de fauna silvestre ha sido obstaculizada por la gran cantidad de trabajo requerido en varios pasos, desde la recolección de muestras hasta la secuenciación. Se han evaluado protocolos alternativos que podrían permitir un mayor rendimiento en dos de estos pasos: muestreo de campo y extracción de ADN. En este trabajo se compararon dos métodos distintos de conservación de las muestras obtenidas en el campo y siete métodos de extracción de ADN para heces de lobos (Canis lupus). Se observó una gran variación en el éxito de genotipado según los protocolos que se sigan. El método de muestreo de campo basado en frotado superficial de los excrementos dio resultados peores que la recolección de un fragmento del excremento. Por otro lado, los protocolos para la extracción de ADN mostraban resultados muy variables y ofrecen mucho margen de optimización y mejora. La optimización de protocolos puede llevar a un monitoreo no invasivo mucho más eficiente, económico y con mayor rendimiento. La selección de marcadores apropiados sigue siendo de importancia vital para incrementar el éxito de genotipado. informacion[at]ebd.csic.es: Sarabia et al (2020) Towards high-throughput analyses of fecal samples from wildlife. Animal Biodiver Conserv 43.2: 271–283 Doi 10.32800/abc.2020.43.0271


http://abc.museucienciesjournals.cat/volum-43-2-2020/towards-high-throughput-analyses-of-fecal-samples-from-wildlife/?lang=en
Promedio (0 Votos)

Últimas noticias Últimas noticias

Atrás

Unificando las de redes de facilitación y reclutamiento

Unificando las de redes de facilitación y reclutamiento

Aunque los estudios sobre redes ecológicas han proporcionado importantes avances en el conocimiento sobre la estabilidad y la dinámica de los ecosistemas, es preocupante el hecho de que este no fuese el caso en ecología de comunidades vegetales. Aunque los primeros estudios sobre redes de facilitación de plantas (FN) se publicaron hace más de una década, el enfoque de redes ecológicas se está integrando muy lentamente en el estudio de las comunidades de plantas. Este trabajo trata de arrojar algo de luz sobre esto discutiendo diferentes razones que pueden haber evitado un uso más extendido de las redes ecológicas en ecología de comunidades vegetales. Una red de reclutamiento (RN) es una red de interacción entre plantas establecidas y plantas que reclutan debajo de ellas, y describe qué plantas reclutan debajo de otras. Son similares a las FN clásicas, pero no implican ningún efecto particular (positivo, negativo o neutral) de las plantas establecidas en las plantas de reclutamiento. La información que contienen puede usarse para construir modelos que describan cómo ciertas especies tienen más probabilidades de ser reemplazadas por otras, que otras especies. Estos modelos son útiles para evaluar cómo la estructura de redes y los diferentes mecanismos involucrados en el ensamblaje de redes pueden afectar la estabilidad de la comunidad vegetal y la coexistencia de especies. En este trabajo se ha intentado unificar los conceptos de FN y RN para facilitar el desarrollo eficiente de su investigación futura. También proponemos pautas metodológicas básicas para estandarizar los métodos de muestreo que podrían hacer que los futuros estudios de estas redes sean directamente comparables. Además, los investigadores interesados están invitados a colaborar en una base de datos global de redes de reclutamiento que estamos construyendo hasta finales de 2020, utilizando los protocolos de muestreo y las recomendaciones proporcionadas. Más información disponible en The Facilitation / Recruitment eLab: http://elabs.ebd.csic.es/web/213936. informacion[at]ebd.csic.es: Alcántara et al (2019) Unifying facilitation and recruitment networks. J Veg Science. DOI 10.1111/jvs.12795


https://onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1111/jvs.12795