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La optimización de protocolos para la extracción de ADN de muestras fecales

La secuenciación de alto rendimiento ofrece nuevas posibilidades en ecología molecular y biología de la conservación. Sin embargo, el potencial de esta técnica no ha sido totalmente explotado para estudios no invasivos, a partir de muestras fecales, de fauna silvestre. La secuenciación de alto rendimiento permite la secuenciación de fragmentos de ADN cortos y podría permitir el genotipado simultáneo de un gran número de muestras y marcadores a un bajo coste. La aplicación de estas técnicas a muestras fecales de fauna silvestre ha sido obstaculizada por la gran cantidad de trabajo requerido en varios pasos, desde la recolección de muestras hasta la secuenciación. Se han evaluado protocolos alternativos que podrían permitir un mayor rendimiento en dos de estos pasos: muestreo de campo y extracción de ADN. En este trabajo se compararon dos métodos distintos de conservación de las muestras obtenidas en el campo y siete métodos de extracción de ADN para heces de lobos (Canis lupus). Se observó una gran variación en el éxito de genotipado según los protocolos que se sigan. El método de muestreo de campo basado en frotado superficial de los excrementos dio resultados peores que la recolección de un fragmento del excremento. Por otro lado, los protocolos para la extracción de ADN mostraban resultados muy variables y ofrecen mucho margen de optimización y mejora. La optimización de protocolos puede llevar a un monitoreo no invasivo mucho más eficiente, económico y con mayor rendimiento. La selección de marcadores apropiados sigue siendo de importancia vital para incrementar el éxito de genotipado. informacion[at]ebd.csic.es: Sarabia et al (2020) Towards high-throughput analyses of fecal samples from wildlife. Animal Biodiver Conserv 43.2: 271–283 Doi 10.32800/abc.2020.43.0271


http://abc.museucienciesjournals.cat/volum-43-2-2020/towards-high-throughput-analyses-of-fecal-samples-from-wildlife/?lang=en
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La anidación esporádica de la tortuga boba revela la colonización exitosa de nuevas zonas

La anidación esporádica de la tortuga boba revela la colonización exitosa de nuevas zonas

La colonización de nuevos hábitats es clave para la supervivencia de especies amenazadas por los cambios en las condiciones climáticas y medioambientales. En el caso de las tortugas marinas, que vuelven a su lugar de nacimiento para reproducirse y nidificar, aunque este se encuentre a miles de kilómetros, cobra aún más importancia hallar regiones adecuadas para la anidación. Se han descubierto nuevas zonas de anidación para la tortuga boba (Caretta caretta), una especie amenazada y la tortuga marina más común en aguas españolas. El análisis de fragmentos del ADN revela que estos nidos son eventos de colonización esporádicos asociados a juveniles nacidos en regiones muy distantes, pero que obtienen el alimento en zonas del litoral de la Península Ibérica. Además, han estudiado la calidad de las playas elegidas por las tortugas y han comprobado que algunas de ellas son adecuadas y viables no sólo en la actualidad, sino también a largo plazo. Según las conclusiones del estudio las playas del Mediterráneo occidental reúnen las condiciones de temperatura adecuadas para asegurar el éxito de los nidos ahora y en el futuro. En las tortugas marinas, el sexo de las crías viene determinado por la temperatura de incubación de los huevos en la arena de las playas. El aumento de la temperatura por el calentamiento global podría explicar la creciente feminización de las crías, relacionada con una menor tasa de supervivencia de la especie. La Caretta caretta es la única tortuga marina que anida con éxito en España y suele hacerlo en playas arenosas, enterrando los huevos a unos 50 centímetros de profundidad. Al descubrir zonas con anidación esporádica exitosa, podemos protegerlas y favorecer con ello una alta productividad de esos nidos aislados. Podemos contribuir al éxito de esa colonización y, por tanto, ayudar a especies amenazadas a resolver un grave problema derivado del calentamiento del clima. informacion[at]ebd.csic.es: Carreras et al (2018) Sporadic nesting reveals long distance colonisation in the philopatric loggerhead sea turtle (Caretta caretta). Scientific Reports Doi 10.1038/s41598-018-19887-w


https://www.nature.com/articles/s41598-018-19887-w