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La optimización de protocolos para la extracción de ADN de muestras fecales

La secuenciación de alto rendimiento ofrece nuevas posibilidades en ecología molecular y biología de la conservación. Sin embargo, el potencial de esta técnica no ha sido totalmente explotado para estudios no invasivos, a partir de muestras fecales, de fauna silvestre. La secuenciación de alto rendimiento permite la secuenciación de fragmentos de ADN cortos y podría permitir el genotipado simultáneo de un gran número de muestras y marcadores a un bajo coste. La aplicación de estas técnicas a muestras fecales de fauna silvestre ha sido obstaculizada por la gran cantidad de trabajo requerido en varios pasos, desde la recolección de muestras hasta la secuenciación. Se han evaluado protocolos alternativos que podrían permitir un mayor rendimiento en dos de estos pasos: muestreo de campo y extracción de ADN. En este trabajo se compararon dos métodos distintos de conservación de las muestras obtenidas en el campo y siete métodos de extracción de ADN para heces de lobos (Canis lupus). Se observó una gran variación en el éxito de genotipado según los protocolos que se sigan. El método de muestreo de campo basado en frotado superficial de los excrementos dio resultados peores que la recolección de un fragmento del excremento. Por otro lado, los protocolos para la extracción de ADN mostraban resultados muy variables y ofrecen mucho margen de optimización y mejora. La optimización de protocolos puede llevar a un monitoreo no invasivo mucho más eficiente, económico y con mayor rendimiento. La selección de marcadores apropiados sigue siendo de importancia vital para incrementar el éxito de genotipado. informacion[at]ebd.csic.es: Sarabia et al (2020) Towards high-throughput analyses of fecal samples from wildlife. Animal Biodiver Conserv 43.2: 271–283 Doi 10.32800/abc.2020.43.0271


http://abc.museucienciesjournals.cat/volum-43-2-2020/towards-high-throughput-analyses-of-fecal-samples-from-wildlife/?lang=en
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Aumento del contenido en el componente benzotiazol del pigmento feomelanina tras inducción de producción endógena de radicales libres

Aumento del contenido en el componente benzotiazol del pigmento feomelanina tras inducción de producción endógena de radicales libres

Se sabe que la feomelanina, la forma azufrada del pigmento melanina, produce especies reactivas de oxígeno (ROS) y citotoxicidad mediada por estrés oxidativo. Estudios previos han mostrado una conversión del contenido en el componente benzotiazina de la feomelanina al componente benzotiazol bajo exposición a calor o radiación energética, pero se desconoce si las condiciones endógenas también pueden producir este cambio estructural. Se indujo experimentalmente una producción endógena de radicales libres exponiendo machos de diamante mandarín Taeniopygia guttata a dibromuro de diputa en agua de bebida durante el desarrollo de plumas del flanco pigmentadas por feomelanina. El ratio benzotiazina:benzotiazol de la feomelanina de las plumas disminuyó más y fue significativamente más bajo en aves tratadas con diquat que en controles. Por lo tanto, los radicales libres encógenos, y no solo la radiación ambiental, pueden promover también cambios estructurales en la feomelanina. Mientras que previamente se asumía que la benzotiazina es responsable de la reacción redox de la feomelanina, resultados recientes sugieren que el benzotiazol tiene una mayor habilidad para consumir antioxidantes. Debería considerarse por tanto la posibilidad de que la suplementación con antioxidantes para limitar los efectos de los radicales libres endógenos pueda contribuir a prevenir el melanoma, una enfermedad que es favorecida por el estrés oxidative producido por la feomelanina. informacion[at]ebd.csic.es: Rodríguez-Martínez et al (2020) Increase of the benzothiazole moiety content of pheomelanin pigment after endogenous free radical inducement. Dyes and Pigments. DOI 10.1016/j.dyepig.2020.108516


https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0143720820308378