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La optimización de protocolos para la extracción de ADN de muestras fecales

La secuenciación de alto rendimiento ofrece nuevas posibilidades en ecología molecular y biología de la conservación. Sin embargo, el potencial de esta técnica no ha sido totalmente explotado para estudios no invasivos, a partir de muestras fecales, de fauna silvestre. La secuenciación de alto rendimiento permite la secuenciación de fragmentos de ADN cortos y podría permitir el genotipado simultáneo de un gran número de muestras y marcadores a un bajo coste. La aplicación de estas técnicas a muestras fecales de fauna silvestre ha sido obstaculizada por la gran cantidad de trabajo requerido en varios pasos, desde la recolección de muestras hasta la secuenciación. Se han evaluado protocolos alternativos que podrían permitir un mayor rendimiento en dos de estos pasos: muestreo de campo y extracción de ADN. En este trabajo se compararon dos métodos distintos de conservación de las muestras obtenidas en el campo y siete métodos de extracción de ADN para heces de lobos (Canis lupus). Se observó una gran variación en el éxito de genotipado según los protocolos que se sigan. El método de muestreo de campo basado en frotado superficial de los excrementos dio resultados peores que la recolección de un fragmento del excremento. Por otro lado, los protocolos para la extracción de ADN mostraban resultados muy variables y ofrecen mucho margen de optimización y mejora. La optimización de protocolos puede llevar a un monitoreo no invasivo mucho más eficiente, económico y con mayor rendimiento. La selección de marcadores apropiados sigue siendo de importancia vital para incrementar el éxito de genotipado. informacion[at]ebd.csic.es: Sarabia et al (2020) Towards high-throughput analyses of fecal samples from wildlife. Animal Biodiver Conserv 43.2: 271–283 Doi 10.32800/abc.2020.43.0271


http://abc.museucienciesjournals.cat/volum-43-2-2020/towards-high-throughput-analyses-of-fecal-samples-from-wildlife/?lang=en
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Aves presentan una peor condición corporal en zonas más urbanizadas

Aves presentan una peor condición corporal en zonas más urbanizadas

El impacto de la urbanización del medio y el cambio en los usos del suelo sobre la fauna silvestre suponen un foco de interés en los estudios de ecología. En este trabajo, se ha estudiado el efecto conjunto de la urbanización y la infección de parásitos sanguíneos de la malaria aviar del género Plasmodium y los parásitos relacionados de los géneros Haemoproteus y Leucocytozoon en las aves silvestres. Para ello, se capturaron 2043 ejemplares de gorrión común (Passer domesticus) en 45 localidades de las provincias de Huelva, Sevilla y Cádiz. Las zonas de estudio incluyeron áreas urbanas que presentaron una alta densidad de personas, áreas rurales caracterizadas por presentar una alta densidad de especies de interés ganadero y áreas naturales que presentaron una menor densidad de personas y especies de interés ganadero además de presentar un grado de conservación mayor. Los principales resultados del estudio apoyan el impacto de la urbanización del medio en el estado de salud de las aves, encontrándose aves con una menor condición corporal en las áreas con un mayor índice de urbanización, lo que puede deberse al efecto adverso de los contaminantes o una alimentación deficiente en las aves. Por el contrario, las aves de áreas rurales, especialmente los juveniles, tuvieron una mayor condición corporal, lo que podría deberse a una mayor disponibilidad de alimento de mayor calidad en estas áreas. Además, los juveniles de gorrión de áreas urbanas infectados por Plasmodium o Haemoproteus presentaron una mayor condición corporal frente a los no infectados. Estos resultados podrían indicar una mayor mortalidad de aves infectadas y con menor condición corporal, debido a su incapacidad de hacer frente a los costes asociados a la respuesta frente a la infección por parásitos en un medio urbano. informacion[at]ebd.csic.es: Jiménez-Peñuela et al (2018) Urbanization and blood parasite infections affect the body condition of wild birds. Sci Total Environ Doi 10.1016/j.scitotenv.2018.10.203


http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0048969718340944