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La optimización de protocolos para la extracción de ADN de muestras fecales

La secuenciación de alto rendimiento ofrece nuevas posibilidades en ecología molecular y biología de la conservación. Sin embargo, el potencial de esta técnica no ha sido totalmente explotado para estudios no invasivos, a partir de muestras fecales, de fauna silvestre. La secuenciación de alto rendimiento permite la secuenciación de fragmentos de ADN cortos y podría permitir el genotipado simultáneo de un gran número de muestras y marcadores a un bajo coste. La aplicación de estas técnicas a muestras fecales de fauna silvestre ha sido obstaculizada por la gran cantidad de trabajo requerido en varios pasos, desde la recolección de muestras hasta la secuenciación. Se han evaluado protocolos alternativos que podrían permitir un mayor rendimiento en dos de estos pasos: muestreo de campo y extracción de ADN. En este trabajo se compararon dos métodos distintos de conservación de las muestras obtenidas en el campo y siete métodos de extracción de ADN para heces de lobos (Canis lupus). Se observó una gran variación en el éxito de genotipado según los protocolos que se sigan. El método de muestreo de campo basado en frotado superficial de los excrementos dio resultados peores que la recolección de un fragmento del excremento. Por otro lado, los protocolos para la extracción de ADN mostraban resultados muy variables y ofrecen mucho margen de optimización y mejora. La optimización de protocolos puede llevar a un monitoreo no invasivo mucho más eficiente, económico y con mayor rendimiento. La selección de marcadores apropiados sigue siendo de importancia vital para incrementar el éxito de genotipado. informacion[at]ebd.csic.es: Sarabia et al (2020) Towards high-throughput analyses of fecal samples from wildlife. Animal Biodiver Conserv 43.2: 271–283 Doi 10.32800/abc.2020.43.0271


http://abc.museucienciesjournals.cat/volum-43-2-2020/towards-high-throughput-analyses-of-fecal-samples-from-wildlife/?lang=en
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El papel de las rapaces en un mundo cambiante

El papel de las rapaces en un mundo cambiante

Las aves de presa han sido, en comparación con otros grupos de aves, más raramente utilizadas como sujeto de estudios en ecología en razón de las limitaciones que impone su estrategia de vida. Por el contrario, han suscitado un gran interés desde el punto de vista de la biología de la conservación, debido a que sus poblaciones en muchos casos se han aproximado a la extinción, así como al reconocimiento de su papel en los ecosistemas como superpredadores y carroñeros como especies bandera. Hoy en día, tras más de un siglo de persecución, y con la excepción de algunos buitres todavía muy afectados por envenenamientos ilegales, muchas especies de aves de presa han experimentado importantes crecimientos poblacionales en muchas regiones de España y del Mediterráneo europeo. Este escenario plantea nuevos desafíos para abordar la conservación de las rapaces en las próximas décadas. Sobre esta base se focaliza la atención en la necesidad de describir y cuantificar el papel de estas aves como proveedores de servicios ecosistémicos, tanto reguladores como culturales y de apoyo. Por otra parte, se llama la atención hacia el reavivamiento de conflictos con intereses humanos y a la aparición de nuevos conflictos con un fuerte componente social y mediático como la predación de aves carroñeras sobre ganado vivo. De igual modo, la creciente humanización del medio y de las poblaciones de aves de presa de mayor tamaño determinan que haya que buscar nuevas soluciones a problemas ya conocidos como los accidentes en infraestructuras, pero que tienen nuevas facetas complejas y aun poco exploradas como la mortalidad en parques eólicos. Finalmente, se investiga la respuesta de las aves de presa a cambios a gran escala en el hábitat, como la urbanización y el abandono de tierras marginales que ya están ocurriendo y se prevé que se incrementen en las próximas décadas. Debe generarse más conocimiento científico para poder dar adecuada respuesta al reto que supone mantener poblaciones sanas de aves predadoras y carroñeras en un mundo que cambia vertiginosamente. informacion[at]ebd.csic.es: Donázar et al (2016) Roles of raptors in a changing world: from flagships to providers of key ecosystem services. Ardeola 63(1) 181-234 doi: http://dx.doi.org/10.13157/arla.63.1.2016.rp8


http://www.ardeola.org/volume/63.1/article/181-234/1686