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La optimización de protocolos para la extracción de ADN de muestras fecales

La secuenciación de alto rendimiento ofrece nuevas posibilidades en ecología molecular y biología de la conservación. Sin embargo, el potencial de esta técnica no ha sido totalmente explotado para estudios no invasivos, a partir de muestras fecales, de fauna silvestre. La secuenciación de alto rendimiento permite la secuenciación de fragmentos de ADN cortos y podría permitir el genotipado simultáneo de un gran número de muestras y marcadores a un bajo coste. La aplicación de estas técnicas a muestras fecales de fauna silvestre ha sido obstaculizada por la gran cantidad de trabajo requerido en varios pasos, desde la recolección de muestras hasta la secuenciación. Se han evaluado protocolos alternativos que podrían permitir un mayor rendimiento en dos de estos pasos: muestreo de campo y extracción de ADN. En este trabajo se compararon dos métodos distintos de conservación de las muestras obtenidas en el campo y siete métodos de extracción de ADN para heces de lobos (Canis lupus). Se observó una gran variación en el éxito de genotipado según los protocolos que se sigan. El método de muestreo de campo basado en frotado superficial de los excrementos dio resultados peores que la recolección de un fragmento del excremento. Por otro lado, los protocolos para la extracción de ADN mostraban resultados muy variables y ofrecen mucho margen de optimización y mejora. La optimización de protocolos puede llevar a un monitoreo no invasivo mucho más eficiente, económico y con mayor rendimiento. La selección de marcadores apropiados sigue siendo de importancia vital para incrementar el éxito de genotipado. informacion[at]ebd.csic.es: Sarabia et al (2020) Towards high-throughput analyses of fecal samples from wildlife. Animal Biodiver Conserv 43.2: 271–283 Doi 10.32800/abc.2020.43.0271


http://abc.museucienciesjournals.cat/volum-43-2-2020/towards-high-throughput-analyses-of-fecal-samples-from-wildlife/?lang=en
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El uso de carreteras es contexto-dependiente

El uso de carreteras es contexto-dependiente

Muchos animales evitan las carreteras debido a las molestias causadas por el tráfico. Sin embargo, existen también especies que las utilizan de forma habitual e incluso obtienen recursos de ellas. Comprender los factores que determinan la medida en que estas especies usan las carreteras puede ayudar a comprender los patrones temporales de mortalidad por atropello y maximizar así el rendimiento de las medidas de mitigación. Este estudio, realizado entre 2009 y 2017 en Doñana, investiga los factores ambientales que influyen en el uso de carreteras por parte del chotacabras cuellirrojo Caprimulgus ruficollis, un ave insectívora nocturna que frecuenta caminos y carreteras para alimentarse y termorregular. La abundancia de chotacabras en las carreteras y caminos muestreados se vio afectada por la temperatura ambiente, la fase lunar y las condiciones de viento, factores que influyen sobre la eficiencia de forrajeo y el comportamiento de termorregulación de estas aves. Específicamente, el uso de carreteras se acentuó durante noches sin viento y con temperaturas extremas, ya fuesen frías o cálidas. Esto sugiere que los chotacabras usan preferentemente las carreteras (i) en condiciones climáticas desfavorables para ayudar a la termorregulación y (ii) durante los períodos de mayor abundancia de insectos (noches cálidas) y buenas condiciones de visibilidad (luna llena) para maximizar la ingesta de insectos. Estos resultados ilustran la capacidad de las condiciones ambientales para impulsar cambios rápidos en el uso de las carreteras por parte de los animales, así como la utilidad de estudios análogos para diseñar medidas de mitigación específicas para aquellos períodos de máxima abundancia de animales en las carreteras. informacion[at]ebd.csic.es: De Felipe et al. (2019) Environmental factors influencing road use in a nocturnal insectivorous bird. Eur J Wildl Res https://doi.org/10.1007/s10344-019-1267-5


https://link.springer.com/article/10.1007/s10344-019-1267-5