Noticias Noticias

La optimización de protocolos para la extracción de ADN de muestras fecales

La secuenciación de alto rendimiento ofrece nuevas posibilidades en ecología molecular y biología de la conservación. Sin embargo, el potencial de esta técnica no ha sido totalmente explotado para estudios no invasivos, a partir de muestras fecales, de fauna silvestre. La secuenciación de alto rendimiento permite la secuenciación de fragmentos de ADN cortos y podría permitir el genotipado simultáneo de un gran número de muestras y marcadores a un bajo coste. La aplicación de estas técnicas a muestras fecales de fauna silvestre ha sido obstaculizada por la gran cantidad de trabajo requerido en varios pasos, desde la recolección de muestras hasta la secuenciación. Se han evaluado protocolos alternativos que podrían permitir un mayor rendimiento en dos de estos pasos: muestreo de campo y extracción de ADN. En este trabajo se compararon dos métodos distintos de conservación de las muestras obtenidas en el campo y siete métodos de extracción de ADN para heces de lobos (Canis lupus). Se observó una gran variación en el éxito de genotipado según los protocolos que se sigan. El método de muestreo de campo basado en frotado superficial de los excrementos dio resultados peores que la recolección de un fragmento del excremento. Por otro lado, los protocolos para la extracción de ADN mostraban resultados muy variables y ofrecen mucho margen de optimización y mejora. La optimización de protocolos puede llevar a un monitoreo no invasivo mucho más eficiente, económico y con mayor rendimiento. La selección de marcadores apropiados sigue siendo de importancia vital para incrementar el éxito de genotipado. informacion[at]ebd.csic.es: Sarabia et al (2020) Towards high-throughput analyses of fecal samples from wildlife. Animal Biodiver Conserv 43.2: 271–283 Doi 10.32800/abc.2020.43.0271


http://abc.museucienciesjournals.cat/volum-43-2-2020/towards-high-throughput-analyses-of-fecal-samples-from-wildlife/?lang=en
Promedio (0 Votos)

Últimas noticias Últimas noticias

Atrás

Invasiones, estructura funcional y procesos ecosistémicos

Numerosos estudios constatan una disminución de especies nativas en comunidades afectadas por invasiones de plantas exóticas, pero las implicaciones de las pérdidas de las especies sobre la estructura funcional de la comunidad y los procesos ecosistémicos han sido menos exploradas. Las preguntas que se plantean son: (1) ¿cuáles son los impactos de los taxones de las plantas invasoras sobre la estructura funcional de la comunidad receptora; y (2) hay vínculos entre dicha estructura funcional y las propiedades de los ecosistemas que representan procesos ecosistémicos claves? El estudio, llevado a cabo en hábitats costeros de las islas Baleares, reveló que la invasión por Carpobrotus condujo a una homogeneización funcional dentro de la comunidad, lo que presumiblemente reduce su resiliencia. La estructura funcional de la comunidad fue más sensible a la invasión que las propiedades de los ecosistemas. La débil relación entre los índices funcionales y las propiedades del ecosistema sugieren que responden a la invasión a velocidades diferentes. informacion[at]ebd.csic.es: Castro-Díez et al (2016) Linking the impacts of plant invasion on community functional structure and ecosystem properties. J Veg Sci DOI: 10.1111/jvs.12429


http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/jvs.12429/full