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La optimización de protocolos para la extracción de ADN de muestras fecales

La secuenciación de alto rendimiento ofrece nuevas posibilidades en ecología molecular y biología de la conservación. Sin embargo, el potencial de esta técnica no ha sido totalmente explotado para estudios no invasivos, a partir de muestras fecales, de fauna silvestre. La secuenciación de alto rendimiento permite la secuenciación de fragmentos de ADN cortos y podría permitir el genotipado simultáneo de un gran número de muestras y marcadores a un bajo coste. La aplicación de estas técnicas a muestras fecales de fauna silvestre ha sido obstaculizada por la gran cantidad de trabajo requerido en varios pasos, desde la recolección de muestras hasta la secuenciación. Se han evaluado protocolos alternativos que podrían permitir un mayor rendimiento en dos de estos pasos: muestreo de campo y extracción de ADN. En este trabajo se compararon dos métodos distintos de conservación de las muestras obtenidas en el campo y siete métodos de extracción de ADN para heces de lobos (Canis lupus). Se observó una gran variación en el éxito de genotipado según los protocolos que se sigan. El método de muestreo de campo basado en frotado superficial de los excrementos dio resultados peores que la recolección de un fragmento del excremento. Por otro lado, los protocolos para la extracción de ADN mostraban resultados muy variables y ofrecen mucho margen de optimización y mejora. La optimización de protocolos puede llevar a un monitoreo no invasivo mucho más eficiente, económico y con mayor rendimiento. La selección de marcadores apropiados sigue siendo de importancia vital para incrementar el éxito de genotipado. informacion[at]ebd.csic.es: Sarabia et al (2020) Towards high-throughput analyses of fecal samples from wildlife. Animal Biodiver Conserv 43.2: 271–283 Doi 10.32800/abc.2020.43.0271


http://abc.museucienciesjournals.cat/volum-43-2-2020/towards-high-throughput-analyses-of-fecal-samples-from-wildlife/?lang=en
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La importancia de polinizadores con alta movilidad para salvaguardar el reclutamiento de poblaciones de árboles

La importancia de polinizadores con alta movilidad para salvaguardar el reclutamiento de poblaciones de árboles

Una dispersión limitada de semillas con frecuencia conduce a una estructuración genética espacial a pequeña escala dentro de las poblaciones de plantas. Dependiendo de su extensión espacial y la movilidad de los polinizadores, este elevado parentesco en la proximidad inmediata puede empobrecer críticamente la calidad del polen. A pesar de la ocurrencia común de una estructuración genética espacial efectiva dentro de las poblaciones de plantas (es decir, la ocurrencia de parentesco genético entre ejemplares localizados en un espacio próximo) nuestro conocimiento sobre el papel de la polinización a larga distancia para prevenir fallos reproductivos aún es limitado. Utilizando marcadores de microsatélites, se examinó la existencia de una estructuración genética espacial efectiva en dos poblaciones de baja densidad del piruétano Pyrus bourgaeana. Se diseñaron cruces controlados entre árboles que diferían en su parentesco para investigar los efectos del aumento del parentesco local en la reproducción de las plantas. Se utilizaron seis tratamientos de polinización y se anotaron en detalle la producción de fruta, el peso del fruto y la semilla, la proporción de semillas maduras por fruta y la germinación de las semillas. Los resultados revelaron una estructura genética espacial efectiva a pequeña escala en ambas poblaciones estudiadas y una menor iniciación de los frutos en flores polinizadas con polen de individuos altamente relacionados genéticamente de la misma zona, intensificándose esta tendencia a medida que avanzaba el desarrollo del fruto. Además, las flores de polinización libre exhibieron un rendimiento inferior en comparación con las polinizadas por donantes de polen distantes, lo que sugiere una intensa limitación cualitativa del polen en las poblaciones naturales. La estructuración genética espacial a pequeña escala se traduce en una calidad de polen empobrecida de los donantes cercanos de polen, lo que afecta negativamente el éxito reproductor de los árboles en poblaciones de baja densidad. En este escenario de rescate genético intrapoblacional por donantes distantes de polen, la relevancia de los polinizadores altamente móviles para conectar parches de árboles espaciales y genéticamente distantes puede ser crucial para salvaguardar el reclutamiento de las poblaciones. informacion[at]ebd.csic.es: Castilla et al (2019) Genetic rescue by distant trees mitigates qualitative pollen limitation imposed by fine-scale spatial genetic structure. Mol Ecol 28 DOI 10.1111/mec.15233


https://onlinelibrary.wiley.com/doi/full/10.1111/mec.15233