Noticias Noticias

La optimización de protocolos para la extracción de ADN de muestras fecales

La secuenciación de alto rendimiento ofrece nuevas posibilidades en ecología molecular y biología de la conservación. Sin embargo, el potencial de esta técnica no ha sido totalmente explotado para estudios no invasivos, a partir de muestras fecales, de fauna silvestre. La secuenciación de alto rendimiento permite la secuenciación de fragmentos de ADN cortos y podría permitir el genotipado simultáneo de un gran número de muestras y marcadores a un bajo coste. La aplicación de estas técnicas a muestras fecales de fauna silvestre ha sido obstaculizada por la gran cantidad de trabajo requerido en varios pasos, desde la recolección de muestras hasta la secuenciación. Se han evaluado protocolos alternativos que podrían permitir un mayor rendimiento en dos de estos pasos: muestreo de campo y extracción de ADN. En este trabajo se compararon dos métodos distintos de conservación de las muestras obtenidas en el campo y siete métodos de extracción de ADN para heces de lobos (Canis lupus). Se observó una gran variación en el éxito de genotipado según los protocolos que se sigan. El método de muestreo de campo basado en frotado superficial de los excrementos dio resultados peores que la recolección de un fragmento del excremento. Por otro lado, los protocolos para la extracción de ADN mostraban resultados muy variables y ofrecen mucho margen de optimización y mejora. La optimización de protocolos puede llevar a un monitoreo no invasivo mucho más eficiente, económico y con mayor rendimiento. La selección de marcadores apropiados sigue siendo de importancia vital para incrementar el éxito de genotipado. informacion[at]ebd.csic.es: Sarabia et al (2020) Towards high-throughput analyses of fecal samples from wildlife. Animal Biodiver Conserv 43.2: 271–283 Doi 10.32800/abc.2020.43.0271


http://abc.museucienciesjournals.cat/volum-43-2-2020/towards-high-throughput-analyses-of-fecal-samples-from-wildlife/?lang=en
Promedio (0 Votos)

Últimas noticias Últimas noticias

Atrás

Las aves limícolas dispersan una amplia variedad de plantas a lo largo de la ruta migratoria atlántica

Las aves limícolas dispersan una amplia variedad de plantas a lo largo de la ruta migratoria atlántica

Apenas existen estudios previos de las plantas dispersadas por aves limícolas (Charadriiformes). A través del muestreo de las heces y egagrópilas de seis especies de aves en Doñana, Inglaterra, Irlanda e Islandia, se encontraron semillas intactas de 27 taxones de plantas, de las cuales 23 carecen del fruto carnoso considerado frecuentemente como diagnóstico de este proceso de endozoocoria. Además, el 89% de las semillas procedían de 20 especies de plantas terrestres, todas con una distribución amplia a lo largo de la ruta migratoria atlántica. Las aves limícolas son excelentes vectores de dispersión a larga distancia (DLD), y las semillas fueron transportadas por aves al comienzo o al final de los vuelos migratorios entre Inglaterra e Islandia. Esta investigación indica que el estudio de la morfología de semillas no es suficiente para identificar los mecanismos de DLD de una planta, y que las plantas acuáticas no son las únicas dispersadas fácilmente por limícolas. Se identificaron cuatro especies exóticas de plantas dispersadas, incluyendo Cotula coronopifolia cuyas semillas germinan fácilmente después de su paso por el tracto digestivo. Esta exótica está extendiéndose rápidamente por los humedales costeros europeos frecuentados por aves limícolas. informacion[at]ebd.csic.es: Lovas-Kiss et al 2018. Shorebirds as important vectors for plant dispersal in Europe. Ecography doi: 10.1111/ecog.04065


https://onlinelibrary.wiley.com/doi/full/10.1111/ecog.04065