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La optimización de protocolos para la extracción de ADN de muestras fecales

La secuenciación de alto rendimiento ofrece nuevas posibilidades en ecología molecular y biología de la conservación. Sin embargo, el potencial de esta técnica no ha sido totalmente explotado para estudios no invasivos, a partir de muestras fecales, de fauna silvestre. La secuenciación de alto rendimiento permite la secuenciación de fragmentos de ADN cortos y podría permitir el genotipado simultáneo de un gran número de muestras y marcadores a un bajo coste. La aplicación de estas técnicas a muestras fecales de fauna silvestre ha sido obstaculizada por la gran cantidad de trabajo requerido en varios pasos, desde la recolección de muestras hasta la secuenciación. Se han evaluado protocolos alternativos que podrían permitir un mayor rendimiento en dos de estos pasos: muestreo de campo y extracción de ADN. En este trabajo se compararon dos métodos distintos de conservación de las muestras obtenidas en el campo y siete métodos de extracción de ADN para heces de lobos (Canis lupus). Se observó una gran variación en el éxito de genotipado según los protocolos que se sigan. El método de muestreo de campo basado en frotado superficial de los excrementos dio resultados peores que la recolección de un fragmento del excremento. Por otro lado, los protocolos para la extracción de ADN mostraban resultados muy variables y ofrecen mucho margen de optimización y mejora. La optimización de protocolos puede llevar a un monitoreo no invasivo mucho más eficiente, económico y con mayor rendimiento. La selección de marcadores apropiados sigue siendo de importancia vital para incrementar el éxito de genotipado. informacion[at]ebd.csic.es: Sarabia et al (2020) Towards high-throughput analyses of fecal samples from wildlife. Animal Biodiver Conserv 43.2: 271–283 Doi 10.32800/abc.2020.43.0271


http://abc.museucienciesjournals.cat/volum-43-2-2020/towards-high-throughput-analyses-of-fecal-samples-from-wildlife/?lang=en
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Las semillas sin fruto carnoso pueden estar adaptadas para endozoocoria

Las semillas sin fruto carnoso pueden estar adaptadas para endozoocoria

En la literatura, muchas veces se da por hecho que tan solo las plantas con frutos carnosos se dispersan dentro del aparato digestivo de los vertebrados, es decir por "endozoocoria". Sin embargo, tan solo el 8% de los angiospermas de Europa continental tienen frutos carnosos, y endozoocoria de otras plantas por aves y mamíferos herbívoros y granívoros es muy frecuente en la naturaleza. Por ejemplo, las aves acuáticas granívoras son vectores para muchas plantas terrestres y acuáticas sin frutos carnosos, proporcionando distancias de dispersión especialmente largas. Pero ¿cómo pueden sus semillas sobrevivir el tránsito por el canal digestivo? ¿Son los mecanismos de resistir la digestión las mismas que se observan en las plantas con frutos carnosos? Usando microscopio electrónico de barrido, y 11 especies de plantas, se compararon la morfología de las semillas antes y después de pasar por el sistema digestivo de ánades azulones. La arquitectura diversa de las semillas y frutos secos se traduce en mecanismos múltiples de resistir la digestión y mantener la viabilidad. No hay diferencias fundamentales en las maneras en las que las semillas de plantas con y sin fruto carnoso se protegen del sistema digestivo. Las dos clases de plantas están pre-adaptadas para la endozoocoria, y para los mutualismos de dispersión de las semillas con sus vectores. informacion[at]ebd.csic.es: Costea et al (2019) The Effect of Gut Passage by Waterbirds on the Seed Coat and Pericarp of Diaspores Lacking "External Flesh": Evidence for Widespread Adaptation to Endozoochory in Angiosperms. PLoS ONE 14(12): e0226551


https://doi.org/10.1371/journal.pone.0226551