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La optimización de protocolos para la extracción de ADN de muestras fecales

La secuenciación de alto rendimiento ofrece nuevas posibilidades en ecología molecular y biología de la conservación. Sin embargo, el potencial de esta técnica no ha sido totalmente explotado para estudios no invasivos, a partir de muestras fecales, de fauna silvestre. La secuenciación de alto rendimiento permite la secuenciación de fragmentos de ADN cortos y podría permitir el genotipado simultáneo de un gran número de muestras y marcadores a un bajo coste. La aplicación de estas técnicas a muestras fecales de fauna silvestre ha sido obstaculizada por la gran cantidad de trabajo requerido en varios pasos, desde la recolección de muestras hasta la secuenciación. Se han evaluado protocolos alternativos que podrían permitir un mayor rendimiento en dos de estos pasos: muestreo de campo y extracción de ADN. En este trabajo se compararon dos métodos distintos de conservación de las muestras obtenidas en el campo y siete métodos de extracción de ADN para heces de lobos (Canis lupus). Se observó una gran variación en el éxito de genotipado según los protocolos que se sigan. El método de muestreo de campo basado en frotado superficial de los excrementos dio resultados peores que la recolección de un fragmento del excremento. Por otro lado, los protocolos para la extracción de ADN mostraban resultados muy variables y ofrecen mucho margen de optimización y mejora. La optimización de protocolos puede llevar a un monitoreo no invasivo mucho más eficiente, económico y con mayor rendimiento. La selección de marcadores apropiados sigue siendo de importancia vital para incrementar el éxito de genotipado. informacion[at]ebd.csic.es: Sarabia et al (2020) Towards high-throughput analyses of fecal samples from wildlife. Animal Biodiver Conserv 43.2: 271–283 Doi 10.32800/abc.2020.43.0271


http://abc.museucienciesjournals.cat/volum-43-2-2020/towards-high-throughput-analyses-of-fecal-samples-from-wildlife/?lang=en
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Los guacamayos dispersores de semillas

Los guacamayos dispersores de semillas

La dispersión de semillas es uno de los mutualismos planta-animal más estudiados. Se ha propuesto que la dispersión de muchas plantas de semillas grandes de bosques neotropicales fue llevada a cabo principalmente por la megafauna extinta, y actualmente por el ganado. Los loros pueden transportar frutas grandes usando sus picos, pero no se han tenido en cuenta como dispersores de semillas. Se demuestra que tres especies de guacamayos son los principales dispersores de una palmera de semilla grande, Attalea princeps,  el árbol que más biomasa produce en las sabanas amazónicas bolivianas. Los guacamayos dispersaron los frutos a altas tasas (75-100% de frutas) hasta posaderos distantes (hasta 1200 m), donde consumieron la pulpa y descartaron las semillas enteras, contribuyendo a la regeneración del bosque y la conectividad entre bosques islas. La distribución espacial de las palmeras inmaduras se asoció positivamente con la proximidad a los árboles utilizados como posaderos por los guacamayos y negativamente con los caminos utilizados por el ganado. El papel dispersor del ganado, presumiblemente el sustituto de la megafauna extinta, tuvo poco efecto debido a la compactación del suelo, el pisoteo y la herbivoría. Estos resultados subrayan la importancia de los guacamayos como legítimos dispersores primarios de plantas de semilla grande a larga distancia y, concretamente, su papel clave en la configuración de la estructura del paisaje y el funcionamiento de este Bioma Amazónico. informacion[at]ebd.csic.es: Baños-Villalba et al (2017) Seed dispersal by macaws shapes the landscape of an Amazonian ecosystem. Sci Rep doi:10.1038/s41598-017-07697-5


https://www.nature.com/articles/s41598-017-07697-5