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La optimización de protocolos para la extracción de ADN de muestras fecales

La secuenciación de alto rendimiento ofrece nuevas posibilidades en ecología molecular y biología de la conservación. Sin embargo, el potencial de esta técnica no ha sido totalmente explotado para estudios no invasivos, a partir de muestras fecales, de fauna silvestre. La secuenciación de alto rendimiento permite la secuenciación de fragmentos de ADN cortos y podría permitir el genotipado simultáneo de un gran número de muestras y marcadores a un bajo coste. La aplicación de estas técnicas a muestras fecales de fauna silvestre ha sido obstaculizada por la gran cantidad de trabajo requerido en varios pasos, desde la recolección de muestras hasta la secuenciación. Se han evaluado protocolos alternativos que podrían permitir un mayor rendimiento en dos de estos pasos: muestreo de campo y extracción de ADN. En este trabajo se compararon dos métodos distintos de conservación de las muestras obtenidas en el campo y siete métodos de extracción de ADN para heces de lobos (Canis lupus). Se observó una gran variación en el éxito de genotipado según los protocolos que se sigan. El método de muestreo de campo basado en frotado superficial de los excrementos dio resultados peores que la recolección de un fragmento del excremento. Por otro lado, los protocolos para la extracción de ADN mostraban resultados muy variables y ofrecen mucho margen de optimización y mejora. La optimización de protocolos puede llevar a un monitoreo no invasivo mucho más eficiente, económico y con mayor rendimiento. La selección de marcadores apropiados sigue siendo de importancia vital para incrementar el éxito de genotipado. informacion[at]ebd.csic.es: Sarabia et al (2020) Towards high-throughput analyses of fecal samples from wildlife. Animal Biodiver Conserv 43.2: 271–283 Doi 10.32800/abc.2020.43.0271


http://abc.museucienciesjournals.cat/volum-43-2-2020/towards-high-throughput-analyses-of-fecal-samples-from-wildlife/?lang=en
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Los humanos y las aves carroñeras facilitan la invasión de hormigas argentinas en el Parque Nacional de Doñana

Los humanos y las aves carroñeras facilitan la invasión de hormigas argentinas en el Parque Nacional de Doñana

La resistencia biótica de las comunidades nativas podría tener un papel en la propagación de especies invasoras. Las comunidades nativas con mayor riqueza de especies serían menos susceptibles a la invasión por especies exóticas que las con menor número de especies, actuando las interacciones interespecíficas como barreras bióticas al crear un entorno altamente competitivo. Este parece ser el caso en la invasión de la hormiga argentina, Linepithema humile, pero solo cuando el ambiente es desfavorable para la supervivencia del invasor. Se estudió el progreso de la invasión de hormigas argentinas a través de hábitats favorables y desfavorables del Parque Nacional de Doñana en tres momentos puntuales que cubren tres décadas (1992, 2000, 2016). Se evaluó la resistencia biótica de la comunidad nativa utilizando la riqueza de especies, así como el dominio y la estructura de la comunidad. También se exploró el papel de los factores abióticos (calidad del hábitat circundante y variables espaciales) y de los vectores potenciales de la dispersión de hormigas argentinas en áreas desfavorables. No se encontró evidencia de resistencia biótica. Por el contrario, la invasión avanzó en árboles con mayor riqueza de especies de hormigas, probablemente porque esos árboles son más grandes y proporcionan más recursos y mejor protección contra la aridez. Además, se encontró evidencia de que la invasión de nuevos árboles a través de una matriz de hábitat desfavorable podría ser influenciada no solo por los humanos, sino también por las aves carroñeras, que podrían actuar como vectores de dispersión de hormigas a través del transporte de carroña consumida también por las hormigas. Dicha expansión a través de los depredadores aéreos podría representar un mecanismo pasado por alto que puede enriquecer nuestra comprensión de las dinámicas de invasión y abrir nuevas oportunidades para el manejo de especies invasoras. informacion[at]ebd.csic.es: Castro-Cobo et al (2019) Humans and scavenging raptors facilitate Argentine ant invasion in Doñana National Park: no counter-effect of biotic resistance. Biol Invasions 21:2221–2232. Doi 10.1007/s10530-019-01971-5


https://link.springer.com/article/10.1007%2Fs10530-019-01971-5