Noticias Noticias

La optimización de protocolos para la extracción de ADN de muestras fecales

La secuenciación de alto rendimiento ofrece nuevas posibilidades en ecología molecular y biología de la conservación. Sin embargo, el potencial de esta técnica no ha sido totalmente explotado para estudios no invasivos, a partir de muestras fecales, de fauna silvestre. La secuenciación de alto rendimiento permite la secuenciación de fragmentos de ADN cortos y podría permitir el genotipado simultáneo de un gran número de muestras y marcadores a un bajo coste. La aplicación de estas técnicas a muestras fecales de fauna silvestre ha sido obstaculizada por la gran cantidad de trabajo requerido en varios pasos, desde la recolección de muestras hasta la secuenciación. Se han evaluado protocolos alternativos que podrían permitir un mayor rendimiento en dos de estos pasos: muestreo de campo y extracción de ADN. En este trabajo se compararon dos métodos distintos de conservación de las muestras obtenidas en el campo y siete métodos de extracción de ADN para heces de lobos (Canis lupus). Se observó una gran variación en el éxito de genotipado según los protocolos que se sigan. El método de muestreo de campo basado en frotado superficial de los excrementos dio resultados peores que la recolección de un fragmento del excremento. Por otro lado, los protocolos para la extracción de ADN mostraban resultados muy variables y ofrecen mucho margen de optimización y mejora. La optimización de protocolos puede llevar a un monitoreo no invasivo mucho más eficiente, económico y con mayor rendimiento. La selección de marcadores apropiados sigue siendo de importancia vital para incrementar el éxito de genotipado. informacion[at]ebd.csic.es: Sarabia et al (2020) Towards high-throughput analyses of fecal samples from wildlife. Animal Biodiver Conserv 43.2: 271–283 Doi 10.32800/abc.2020.43.0271


http://abc.museucienciesjournals.cat/volum-43-2-2020/towards-high-throughput-analyses-of-fecal-samples-from-wildlife/?lang=en
Promedio (0 Votos)

Últimas noticias Últimas noticias

Atrás

Mortalidad de fauna en las carreteras de Lanzarote

Mortalidad de fauna en las carreteras de Lanzarote

Las Islas Canarias son un importante destino turístico que ha experimentado un desarrollo significativo de áreas urbanas y redes de carreteras durante las últimas décadas. Sin embargo, no existen estudios que describan la mortalidad de fauna en sus carreteras. Aquí se investigan los patrones temporales y espaciales de la mortalidad de fauna en Lanzarote (Reserva de la Biosfera de la UNESCO). Se registró un total de 666 atropellos (promedio mensual de 0.09 aves / km y 0.14 mamíferos / km) comprendiendo al menos 37 especies de aves nativas y mamíferos introducidos. La abundancia estacional, la riqueza y la diversidad de la mortalidad mostraron un aumento durante los meses de verano tanto para los mamíferos como para las aves. Estos hallazgos destacan que las carreteras son una amenaza potencial para las aves nativas en las Islas Canarias orientales, pues se estiman que más de 7000 aves son atropelladas al año. Se necesitan con urgencia estudios detallados sobre la dinámica de la población local de las especies altamente afectadas, como la hubara, el alcaraván común, la lechuza común o el alcaudón meridional, para determinar si estos niveles de mortalidad vial son sostenibles. informacion[at]ebd.csic.es Tejera et al (2018) Wildlife-vehicle collisions in Lanzarote Biosphere Reserve, Canary Islands. PLoS ONE https://doi.org/10.1371/journal.pone.0192731


http://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0192731