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La optimización de protocolos para la extracción de ADN de muestras fecales

La secuenciación de alto rendimiento ofrece nuevas posibilidades en ecología molecular y biología de la conservación. Sin embargo, el potencial de esta técnica no ha sido totalmente explotado para estudios no invasivos, a partir de muestras fecales, de fauna silvestre. La secuenciación de alto rendimiento permite la secuenciación de fragmentos de ADN cortos y podría permitir el genotipado simultáneo de un gran número de muestras y marcadores a un bajo coste. La aplicación de estas técnicas a muestras fecales de fauna silvestre ha sido obstaculizada por la gran cantidad de trabajo requerido en varios pasos, desde la recolección de muestras hasta la secuenciación. Se han evaluado protocolos alternativos que podrían permitir un mayor rendimiento en dos de estos pasos: muestreo de campo y extracción de ADN. En este trabajo se compararon dos métodos distintos de conservación de las muestras obtenidas en el campo y siete métodos de extracción de ADN para heces de lobos (Canis lupus). Se observó una gran variación en el éxito de genotipado según los protocolos que se sigan. El método de muestreo de campo basado en frotado superficial de los excrementos dio resultados peores que la recolección de un fragmento del excremento. Por otro lado, los protocolos para la extracción de ADN mostraban resultados muy variables y ofrecen mucho margen de optimización y mejora. La optimización de protocolos puede llevar a un monitoreo no invasivo mucho más eficiente, económico y con mayor rendimiento. La selección de marcadores apropiados sigue siendo de importancia vital para incrementar el éxito de genotipado. informacion[at]ebd.csic.es: Sarabia et al (2020) Towards high-throughput analyses of fecal samples from wildlife. Animal Biodiver Conserv 43.2: 271–283 Doi 10.32800/abc.2020.43.0271


http://abc.museucienciesjournals.cat/volum-43-2-2020/towards-high-throughput-analyses-of-fecal-samples-from-wildlife/?lang=en
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Una mayor diversidad epigenética podría aliviar la pérdida de diversidad genética

Una mayor diversidad epigenética podría aliviar la pérdida de diversidad genética

La diversidad genética se ha considerado tradicionalmente el principal determinante del cambio evolutivo, mientras que en la actualidad se reconoce la diversidad epigenética como una capa de variación heredable adicional con posibles consecuencias adaptativas. Por ejemplo, la diversidad epigenética podría a veces aliviar la pérdida de diversidad genética (poblaciones fragmentadas, hábitats estresantes) y proporcionar un mecanismo de "respaldo evolutivo" para las plantas silvestres. Este estudio compara la diversidad genética y epigenética en siete pares de especies congenéricas con distribuciones amplias y restringidas en las montañas del sureste de la Península Ibérica. Los resultados sugieren que una mayor diversidad epigenética podría aliviar la pérdida de diversidad genética en algunas poblaciones de plantas endémicas, pero también como otras características de las plantas pueden ser esenciales para comprender la relación entre las diversidades genéticas y epigenéticas de poblaciones silvestres. informacion[at]ebd.csic.es: Medrano et al (2020) Comparative genetic and epigenetic diversity in pairs of sympatric, closely-related plants with contrasting distribution ranges in southeastern Iberian mountains. AoB PLANTS DOI 10.1093/aobpla/plaa013


https://academic.oup.com/aobpla/advance-article/doi/10.1093/aobpla/plaa013/5817813