Noticias Noticias

Demographically-based evaluation of genomic regions under selection in domestic dogs

Dingo

Identification of the genomic regions under selection during dog domestication is extremely challenging because the demographic fluctuations associated with domestication can produce signals in polymorphism data that mimic those imposed by selective sweeps. Here authors perform the first analysis of selection on the dog lineage that explicitly incorporates a demographic model, that by controlling for the rate of false discovery, more robustly identifies targets of selection. To do so, a selection scan was conducted using three wolf genomes representing the putative centers of dog domestication, two basal dog breeds (Basenji and Dingo), and a golden jackal as outgroup, for which a demographic model was previously inferred. It was found that our demographically informed analyses filters out many signals that would be otherwise classified as putative selection signals under an empirical outlier approach. Sixty-eight regions of the genome were identified that have likely experienced positive selection. Besides identifying a number of new neurobehavioral candidate genes, the candidate regions contain genes related to lipid metabolism, including CCRN4L, which is centered in the 3rd ranked region. This suggests a previously unreported locus of dietary adaptation, potentially due to the change in diet composition as hunting efficiency increased when proto dogs began hunting alongside hunter-gatherers. informacion[at]ebd.csic.es: Freedman et al (2016) Demographically-based evaluation of genomic regions under selection in domestic dogs. PLoS Genet 12(3): e1005851. DOI:10.1371/journal.pgen.1005851


http://journals.plos.org/plosgenetics/article?id=info:doi/10.1371/journal.pgen.1005851
Promedio (0 Votos)

Últimas noticias Últimas noticias

La abeja doméstica ha aumentado exponencialmente en la cuenca del Mediterráneo

La cuenca del Mediterráneo alberga aproximadamente 3.300 especies de abejas silvestres; aproximadamente el 87% de las que se dan en toda la región paleártica occidental. Contra lo que se suele leer...

Marabuntas de hormigas legionarias en los nidos de Tortugas de Laúd

La mortalidad de los huevos es uno de los principales factores que afectan a la historia de la vida y la conservación de especies ovíparas. Se describe una colonización masiva y críptica de muchos...

El impacto humano ha contribuido al declive del lince boreal en Europa

Entender la contribución de los procesos evolutivos a largo plazo y los recientes impactos antropogénicos a las actuales pautas genéticas de las especies silvestres es fundamental para evaluar los...

Una elevada presión ganadera influye negativamente en la condición corporal del guirre canario

Rasgos individuales como la masa corporal pueden servir como señales de alerta temprana de cambios en la salud de poblaciones de animales que se enfrentan a impactos ambientales. Un estudio sobre...

Comprender las complejas relaciones entre las características ecológicas y los patrones de distribución espacial

El estudio de la relación entre la amplitud del nicho ecológico y la distribución espacial de las especies ha sido un tema central en la ecología. La amplitud del nicho ecológico mide el grado de...