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Identificación de regiones genómicas bajo selección en perros domésticos

Dingo

La identificación de regiones del genoma que han estado bajo selección durante la domesticación del perro es extremadamente difícil debido a las fluctuaciones demográficas asociadas con la domesticación. Estas fluctuaciones pueden producir cambios en la distribución de la variabilidad genética que imitan a los impuestos por los barridos selectivos. En este estudio se ha llevado a cabo el primer análisis de selección en perros que incorpora explícitamente un modelo demográfico, lo que permite una identificación más robusta de los objetivos de selección. Se han analizado tres genomas de lobos que representan posibles centros de la domesticación del perro, dos perros de razas primitivas (Basenji y Dingo), y un chacal común, para los que en un estudio previo se infirió un modelo demográfico. Los análisis, teniendo en cuenta la demografía, permitieron excluir muchas regiones que si hubiesen sido analizadas mediante una aproximación tradicional habrían sido identificadas como regiones bajo selección. Por otro lado, se identificaron 68 regiones del genoma que probablemente han experimentado selección positiva. Además de una serie de nuevos genes candidatos que afectan a funciones neurológicas y comportamientos, las regiones candidatas contienen genes relacionados con el metabolismo de los lípidos, incluyendo CCRN4L. Este locus puede reflejar una adaptación en la dieta, posiblemente debida al cambio en la composición de la alimentación asociada a un incremento en la eficiencia de la caza cuando los proto-perros comenzaron a cazar junto a cazadores-recolectores. informacion[at]ebd.csic.es: Freedman et al (2016) Demographically-based evaluation of genomic regions under selection in domestic dogs. PLoS Genet 12(3): e1005851. DOI:10.1371/journal.pgen.1005851


http://journals.plos.org/plosgenetics/article?id=info:doi/10.1371/journal.pgen.1005851
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