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Laboratorios

El LEM está formado por 5 laboratorios cada uno de los cuales tiene una función, distribución del espacio y equipamiento distinto. Además cuenta con una sala con 4 ordenadores a disposición de los usuarios, con software especializado necesarios para el análisis de datos, especialmente de análisis de secuencias y de fragmentos.

Lab 1: Destinado al manejo de muestras y extracción de ADN:
Su uso principal es cualquier manipulación y preparación de muestras para la extracción, purificación y cuantificación de ADN. Almacenamiento de muestras y de extractos de ADN de uso cotidiano.

Lab 2: Su uso principal es la preparación de soluciones y de reacciones de PCR. Para evitar contaminaciones no está permitida la entrada de ADN. Almacenamiento de reactivos de PCR.

Lab 3 o post-PCR: Se dedica a la manipulación y análisis de productos de PCR (electroforesis, documentación de geles, cuantificación, mezclas de marcadores microsatelites, secuenciación y análisis de fragmentos). Para prevenir problemas de contaminación, toda manipulación de productos de PCR se realiza solo en este laboratorio. Almacenamiento de productos de PCR.

Laboratorio aislado: Está destinado a la manipulación y extracción de ADN de muestras de ADN escaso y degradado (muestras de museo, excrementos, huesos, pelos, plumas), procedimientos que requieren un aislamiento total de otras fuentes de ADN y productos de PCR. El laboratorio está dividido entre extracción de ADN y preparación de reactivos y PCRs.  Almacenamiento de reactivos y ADN de baja calidad. Este laboratorio está restringido a personal con entrenamiento, conocimiento de las normas y precauciones necesarias para evitar problemas de contaminaciones.

Laboratorio antiguo: Está destinado a la manipulación y extracción de ADN muy degradado, de muestras de especimenes de museo, restos arqueológicos, restos fósiles de cientos, miles e incluso millones de años. Este laboratorio, como el aislado, está dividido entre extracción de ADN y preparación de reactivos y PCR.  El acceso está aun más restringido a personal con entrenamiento en trabajo con ADN muy degradado.
 


Equipamiento

Infraestructura Básica:

En la actualidad el LEM cuenta con los equipos necesarios para la aplicación de técnicas básicas de genética molecular.

Aparatos de uso general: Frigoríficos, congeladores y ultracongeladores, balanzas, pHmetro, purificador de agua (destilada y ultra pura), cabinas de flujo laminar, cabina de extracción de gases, centrífugas, tissue lyser, pipetas, etc.

Electroforesis de ADN e isozimas: cubetas submarinas, verticales, fuentes de alimentación y sistemas de foto documentación digital. (Ubicación Laboratorio 3)

PCR: once termocicladores  que incluyen 4 equipos con gradiente de temperatura y un termociclador para QPCR y PCR a tiempo real. (Ubicación Laboratorio 3)

Secuenciador automatico: Analizador de fragmentos basado en fluorescencia (ABI 3130 xl de 16 capilares, Applied Biosystems). (Ubicación Laboratorio 3.)
The lab houses a 16 capillary sequencer ABI PRISM 3130XL from Applied Biosystems based on fluorescence.

Robots: Plataforma robotizada de manejo de líquidos (Ubicación Laboratorio 1 y  Laboratorio 3). EVO freedom de la empresa Tecan.

Nanodrop 2000: Espectrofotómetro de micro volumen (0.2 -2 microlitos) para la cuantificación de ADN, ARN y proteínas. (Ubicación Laboratorio 1)

Fluorímetro: equipo de medida de fluorescencia que permite la cuantificación de cantidades pequeñas de ADN de doble cadena (ds DNA). Quantifluor St (single tube) de Promega. (Ubicación Laboratorio 3)

El bioanalizador 2100: plataforma basada en la microfluídica que permite el análisis electroforético, para asignar tamaño, cuantificar y tener un control de calidad de ADN, RNA, proteínas y células. Bioanalyzer de Agilent Technologies. (Ubicación Laboratorio 3)

Pirosecuenciador: sistema completo de secuenciación automática de DNA de segunda generación, compuesto de: secuenciador GS Junior, workstation y software de análisis y ensamblaje. El secuenciador genera más de 100.000 secuencias para librerías shotgun y >70.000 secuencias para amplicones. de hasta 400 pares de bases cada una por carrera. GS Junior system 454 Life Sciences de ROCHE. (Ubicación Laboratorio 3)

Software: Sequencher (genecodes), Genemapper (Applied biosystems), Gpro (Biotechvana), Geneious (Biomatters)