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La optimización de protocolos para la extracción de ADN de muestras fecales

La secuenciación de alto rendimiento ofrece nuevas posibilidades en ecología molecular y biología de la conservación. Sin embargo, el potencial de esta técnica no ha sido totalmente explotado para estudios no invasivos, a partir de muestras fecales, de fauna silvestre. La secuenciación de alto rendimiento permite la secuenciación de fragmentos de ADN cortos y podría permitir el genotipado simultáneo de un gran número de muestras y marcadores a un bajo coste. La aplicación de estas técnicas a muestras fecales de fauna silvestre ha sido obstaculizada por la gran cantidad de trabajo requerido en varios pasos, desde la recolección de muestras hasta la secuenciación. Se han evaluado protocolos alternativos que podrían permitir un mayor rendimiento en dos de estos pasos: muestreo de campo y extracción de ADN. En este trabajo se compararon dos métodos distintos de conservación de las muestras obtenidas en el campo y siete métodos de extracción de ADN para heces de lobos (Canis lupus). Se observó una gran variación en el éxito de genotipado según los protocolos que se sigan. El método de muestreo de campo basado en frotado superficial de los excrementos dio resultados peores que la recolección de un fragmento del excremento. Por otro lado, los protocolos para la extracción de ADN mostraban resultados muy variables y ofrecen mucho margen de optimización y mejora. La optimización de protocolos puede llevar a un monitoreo no invasivo mucho más eficiente, económico y con mayor rendimiento. La selección de marcadores apropiados sigue siendo de importancia vital para incrementar el éxito de genotipado. informacion[at]ebd.csic.es: Sarabia et al (2020) Towards high-throughput analyses of fecal samples from wildlife. Animal Biodiver Conserv 43.2: 271–283 Doi 10.32800/abc.2020.43.0271


http://abc.museucienciesjournals.cat/volum-43-2-2020/towards-high-throughput-analyses-of-fecal-samples-from-wildlife/?lang=en
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Agresión entre hermanos y estrategias de historia de vida en rapaces (Accipítridae)

Agresión entre hermanos y estrategias de historia de vida en rapaces (Accipítridae)

La competencia agresiva por el alimento entre hermanos durante las etapas tempranas del desarrollo es un rasgo poco frecuente en los animales en general, pero muy prevalente e intenso en algunas familias de aves y en especial las rapaces. La agresión virulenta en este grupo se sabe que está asociada a un síndrome de caracteres que incluye un gran tamaño corporal, puestas pequeñas, tasas de ceba infrecuentes y desarrollo postnatal lento. En este trabajo, se utilizan análisis comparativos filogenéticos para evaluar la importancia relativa de distintas variables de comportamiento, morfológicas, de historia de vida y ecológicas como predictores de la intensidad de la agresión entre hermanos en 65 especies de rapaces. Los resultados muestran que la agresión es más intensa en especies con bajo esfuerzo reproductor (puestas pequeñas y bajas tasas de ceba), mientras que los efectos del tamaño (masa del adulto y duración del crecimiento postnatal) no son factores importantes. La agresión virulenta parece estar causada por una historia de vida lenta (elevada supervivencia unida a un bajo esfuerzo reproductor), en lugar de por una limitación en el suministro de alimento o un gran tamaño corporal. Al incluir en el análisis diversas variables ecológicas que pueden afectar a la abundancia y disponibilidad de presas, se revela que ciertos estilos de vida (por ejemplo, criar en habitats estables o alimentarse de presas difíciles de capturar) pueden contribuir a frenar el ritmo de historia de vida de una especie y favorecer la evolución de agresión virulenta entre hermanos de nido. informacion[at]ebd.csic.es: Redondo et al (2019) Broodmate aggression and life history variation in accipitrid birds of prey. Ecol Evol https://doi.org/10.1002/ece3.5466


https://onlinelibrary.wiley.com/doi/full/10.1002/ece3.5466