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La optimización de protocolos para la extracción de ADN de muestras fecales

La secuenciación de alto rendimiento ofrece nuevas posibilidades en ecología molecular y biología de la conservación. Sin embargo, el potencial de esta técnica no ha sido totalmente explotado para estudios no invasivos, a partir de muestras fecales, de fauna silvestre. La secuenciación de alto rendimiento permite la secuenciación de fragmentos de ADN cortos y podría permitir el genotipado simultáneo de un gran número de muestras y marcadores a un bajo coste. La aplicación de estas técnicas a muestras fecales de fauna silvestre ha sido obstaculizada por la gran cantidad de trabajo requerido en varios pasos, desde la recolección de muestras hasta la secuenciación. Se han evaluado protocolos alternativos que podrían permitir un mayor rendimiento en dos de estos pasos: muestreo de campo y extracción de ADN. En este trabajo se compararon dos métodos distintos de conservación de las muestras obtenidas en el campo y siete métodos de extracción de ADN para heces de lobos (Canis lupus). Se observó una gran variación en el éxito de genotipado según los protocolos que se sigan. El método de muestreo de campo basado en frotado superficial de los excrementos dio resultados peores que la recolección de un fragmento del excremento. Por otro lado, los protocolos para la extracción de ADN mostraban resultados muy variables y ofrecen mucho margen de optimización y mejora. La optimización de protocolos puede llevar a un monitoreo no invasivo mucho más eficiente, económico y con mayor rendimiento. La selección de marcadores apropiados sigue siendo de importancia vital para incrementar el éxito de genotipado. informacion[at]ebd.csic.es: Sarabia et al (2020) Towards high-throughput analyses of fecal samples from wildlife. Animal Biodiver Conserv 43.2: 271–283 Doi 10.32800/abc.2020.43.0271


http://abc.museucienciesjournals.cat/volum-43-2-2020/towards-high-throughput-analyses-of-fecal-samples-from-wildlife/?lang=en
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Caminando sobre el lado oscuro: la luz ambiental afecta el comportamiento del pingüino enano

Caminando sobre el lado oscuro: la luz ambiental afecta el comportamiento del pingüino enano

El pingüino enano es la más pequeña y única especie de pingüino cuya actividad en tierra es estrictamente nocturna. Se han utilizado 13 años de datos de visitas a la colonia para estudiar los efectos de la luz del sol, la luna y luz artificial en el patrón de visitas en Phillip Island, Australia. Sistemas automatizados registraron los pingüinos marcados individualmente cada vez que llegaron (después de la puesta del sol) o partieron (antes del amanecer) de dos colonias bajo diferentes condiciones de iluminación: cielo nocturno natural y luces artificiales usadas para el ecoturismo en torno a la puesta del sol. La luz del sol tuvo un fuerte efecto en las visitas y salidas. Los pingüinos llegaron en promedio alrededor de 81 minutos después de la puesta del sol y se fueron alrededor de 92 minutos antes de la salida del sol. El efecto de la luz de la luna fue también fuerte, siendo más fuerte en las salidas que en las llegadas. Aunque la luz lunar podría ser anulada por la luz artificial en la colonia iluminada artificialmente, los patrones de llegadas y salidas fueron similares entre las colonias, lo que sugiere que la luz artificial no enmascara el efecto de luz de la luna. informacion[at]ebd.csic.es Rodriguez et al (2016) Waddling on the dark side. Ambient light affects attendance behavior of little penguins. J Biol Rhythms doi: 10.1177/0748730415626010


http://jbr.sagepub.com/content/31/2/194