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La optimización de protocolos para la extracción de ADN de muestras fecales

La secuenciación de alto rendimiento ofrece nuevas posibilidades en ecología molecular y biología de la conservación. Sin embargo, el potencial de esta técnica no ha sido totalmente explotado para estudios no invasivos, a partir de muestras fecales, de fauna silvestre. La secuenciación de alto rendimiento permite la secuenciación de fragmentos de ADN cortos y podría permitir el genotipado simultáneo de un gran número de muestras y marcadores a un bajo coste. La aplicación de estas técnicas a muestras fecales de fauna silvestre ha sido obstaculizada por la gran cantidad de trabajo requerido en varios pasos, desde la recolección de muestras hasta la secuenciación. Se han evaluado protocolos alternativos que podrían permitir un mayor rendimiento en dos de estos pasos: muestreo de campo y extracción de ADN. En este trabajo se compararon dos métodos distintos de conservación de las muestras obtenidas en el campo y siete métodos de extracción de ADN para heces de lobos (Canis lupus). Se observó una gran variación en el éxito de genotipado según los protocolos que se sigan. El método de muestreo de campo basado en frotado superficial de los excrementos dio resultados peores que la recolección de un fragmento del excremento. Por otro lado, los protocolos para la extracción de ADN mostraban resultados muy variables y ofrecen mucho margen de optimización y mejora. La optimización de protocolos puede llevar a un monitoreo no invasivo mucho más eficiente, económico y con mayor rendimiento. La selección de marcadores apropiados sigue siendo de importancia vital para incrementar el éxito de genotipado. informacion[at]ebd.csic.es: Sarabia et al (2020) Towards high-throughput analyses of fecal samples from wildlife. Animal Biodiver Conserv 43.2: 271–283 Doi 10.32800/abc.2020.43.0271


http://abc.museucienciesjournals.cat/volum-43-2-2020/towards-high-throughput-analyses-of-fecal-samples-from-wildlife/?lang=en
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La localización del nido después de la migración en el paiño europeo

La localización del nido después de la migración en el paiño europeo

Los paiños exhiben una fuerte filopatría y años tras años vuelven al mismo sitio para reproducirse. Durante la reproducción, algunas especies de petreles dependen del olfato para localizar a su nido en la oscuridad; sin embargo, los mecanismos involucrados en el comportamiento de regreso al nido después de varios meses en el mar son prácticamente desconocidos. Para entender si el olfato también participa en la localización del nido después de la migración y estudiar la interacción con otras señales posicionales, se ha analizado el comportamiento de fidelidad al sitio en el paiño europeo. Durante dos inviernos consecutivos, en una colonia con cajas nidos muy usadas y estudiadas durante las últimas dos décadas, se desplazaron las cajas nido a finales del invierno y se comprobó la elección del nido en la siguiente temporada de cría. Casi todos los individuos volvieron a anidar en la misma localización del año anterior, independientemente de si la caja nido fuera la misma u otra. Además, durante la época de cría, se testó la preferencia olfativa para la caja nido ocupada con respecto a otra al azar. Una vez más, los paiños no mostraron ninguna preferencia olfativa por su nido. Este estudio revela que los paiños europeos basan su capacidad para volver al sitio de cría en señales que no son las olfativas y sugiere una combinación de señales táctiles y propioceptivas como mecanismo para encontrar el nido en la oscuridad. informacion[at]ebd.csic.es: Dell'Ariccia G et al 2015 Mediterranean storm petrels rely on nest position for homing after migration: a test with artificial nest-boxes Anim Behav 107:97-104. DOI information: 10.1016/j.anbehav.2015.06.010


http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0003347215002274