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La optimización de protocolos para la extracción de ADN de muestras fecales

La secuenciación de alto rendimiento ofrece nuevas posibilidades en ecología molecular y biología de la conservación. Sin embargo, el potencial de esta técnica no ha sido totalmente explotado para estudios no invasivos, a partir de muestras fecales, de fauna silvestre. La secuenciación de alto rendimiento permite la secuenciación de fragmentos de ADN cortos y podría permitir el genotipado simultáneo de un gran número de muestras y marcadores a un bajo coste. La aplicación de estas técnicas a muestras fecales de fauna silvestre ha sido obstaculizada por la gran cantidad de trabajo requerido en varios pasos, desde la recolección de muestras hasta la secuenciación. Se han evaluado protocolos alternativos que podrían permitir un mayor rendimiento en dos de estos pasos: muestreo de campo y extracción de ADN. En este trabajo se compararon dos métodos distintos de conservación de las muestras obtenidas en el campo y siete métodos de extracción de ADN para heces de lobos (Canis lupus). Se observó una gran variación en el éxito de genotipado según los protocolos que se sigan. El método de muestreo de campo basado en frotado superficial de los excrementos dio resultados peores que la recolección de un fragmento del excremento. Por otro lado, los protocolos para la extracción de ADN mostraban resultados muy variables y ofrecen mucho margen de optimización y mejora. La optimización de protocolos puede llevar a un monitoreo no invasivo mucho más eficiente, económico y con mayor rendimiento. La selección de marcadores apropiados sigue siendo de importancia vital para incrementar el éxito de genotipado. informacion[at]ebd.csic.es: Sarabia et al (2020) Towards high-throughput analyses of fecal samples from wildlife. Animal Biodiver Conserv 43.2: 271–283 Doi 10.32800/abc.2020.43.0271


http://abc.museucienciesjournals.cat/volum-43-2-2020/towards-high-throughput-analyses-of-fecal-samples-from-wildlife/?lang=en
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Las potenciales amenazas del diclofenaco para los buitres leonados en España

Las potenciales amenazas del diclofenaco para los buitres leonados en España

España mantiene más del 95% de la población reproductora europea de buitre leonado. Los buitres proporcionan servicios ecosistémicos importantes, eliminando cadáveres de animales e influyen en las emisiones de gases de efecto invernadero. A pesar de la conocida toxicidad para esta especie y para otros buitres del diclofenaco, un medicamento anti-inflamatorio no esteroideo, en marzo de 2013 la Agencia Española de Medicamentos y Productos Sanitarios (AEMPS) aprobó el uso veterinario en caballos, cerdos y ganado vacuno de dos medicamentos contenientes diclofenaco. Para evaluar el impacto potencial de los cadáveres de ungulados medicados en las poblaciones de buitre leonado en España, se utilizó información sobre el metabolismo y la eliminación de diclofenaco en bovinos y cerdos medicados. En segundo lugar, en base a los estudios experimentales de toxicidad del diclofenaco, se calcularon las probabilidades de muerte de un buitre por cada comida. Por último, para obtener el número anual esperado de muertes de buitres causadas por diclofenaco, se multiplicaron los índices de mortalidad por comida por el número estimado de comidas según el número de carcasas medicadas sugeridas por la AEMPS. Suponiendo que los buitres se alimentan de cadáveres que fueron tratados con diclofenaco 8 horas antes de la muerte del animal, se estima que el número anual de buitres muertos por el diclofenaco varía entre 715 y 6389. Utilizando un modelo de simulación independiente de la densidad de la población de buitres, la tasa esperada de disminución de la población española de buitres leonados por este factor es 0,9-7,7% por año. Debido a la posibilidad de causar un impacto importante en las poblaciones de buitres, estos hallazgos justifican la prohibición preventiva en el uso veterinario de diclofenaco en España y alientan el uso de meloxicam, un medicamento alternativo seguro. Para asegurar que no haya un nivel perjudicial de contaminación, sería necesario un programa de vigilancia de cadáveres de ungulados contaminados por fármacos anti-inflamatorios no esteroideos a disposición de los buitres, y de otras aves carroñeras. informacion[at]ebd.csic.es: Green et al (2016) Potential threat to Eurasian griffon vultures in Spain from veterinary use of the drug diclofenac. J Appl Ecol  53: 993–1003. doi:10.1111/1365-2664.12663


http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/1365-2664.12663/full