Noticias Noticias

La optimización de protocolos para la extracción de ADN de muestras fecales

La secuenciación de alto rendimiento ofrece nuevas posibilidades en ecología molecular y biología de la conservación. Sin embargo, el potencial de esta técnica no ha sido totalmente explotado para estudios no invasivos, a partir de muestras fecales, de fauna silvestre. La secuenciación de alto rendimiento permite la secuenciación de fragmentos de ADN cortos y podría permitir el genotipado simultáneo de un gran número de muestras y marcadores a un bajo coste. La aplicación de estas técnicas a muestras fecales de fauna silvestre ha sido obstaculizada por la gran cantidad de trabajo requerido en varios pasos, desde la recolección de muestras hasta la secuenciación. Se han evaluado protocolos alternativos que podrían permitir un mayor rendimiento en dos de estos pasos: muestreo de campo y extracción de ADN. En este trabajo se compararon dos métodos distintos de conservación de las muestras obtenidas en el campo y siete métodos de extracción de ADN para heces de lobos (Canis lupus). Se observó una gran variación en el éxito de genotipado según los protocolos que se sigan. El método de muestreo de campo basado en frotado superficial de los excrementos dio resultados peores que la recolección de un fragmento del excremento. Por otro lado, los protocolos para la extracción de ADN mostraban resultados muy variables y ofrecen mucho margen de optimización y mejora. La optimización de protocolos puede llevar a un monitoreo no invasivo mucho más eficiente, económico y con mayor rendimiento. La selección de marcadores apropiados sigue siendo de importancia vital para incrementar el éxito de genotipado. informacion[at]ebd.csic.es: Sarabia et al (2020) Towards high-throughput analyses of fecal samples from wildlife. Animal Biodiver Conserv 43.2: 271–283 Doi 10.32800/abc.2020.43.0271


http://abc.museucienciesjournals.cat/volum-43-2-2020/towards-high-throughput-analyses-of-fecal-samples-from-wildlife/?lang=en
Promedio (0 Votos)

Últimas noticias Últimas noticias

Atrás

Los cultivos de floración masiva en paisajes agrícolas heterogéneos pueden reducir la abundancia de abejas en zonas naturales adyacentes

Los cultivos de floración masiva en paisajes agrícolas heterogéneos pueden reducir la abundancia de abejas en zonas naturales adyacentes

Los polinizadores pueden desplazarse entre diferentes hábitats con el fin de realizar su función de polinización cuando la oferta de recursos florales difiere en el tiempo o en el espacio. Los cultivos de plantas con flor ofrecen puntualmente gran abundancia de recursos  florales (cultivos de floración masiva) que pueden promover este desplazamiento o vertido de polinizadores entre ellos y las áreas naturales adyacentes. En este trabajo se explora la polinización de cultivos de floración masiva de la leguminosa Hedysarum coronarium y su influencia en la comunidad de abejas en las zonas naturales adyacentes en un paisaje agrícola parcheado y heterogéneo, y se estudia el vertido de polinizadores en el tiempo y en el espacio. La abeja de la miel resultó ser muy atraída hacia los cultivos de Hedysarum, mientras que su abundancia en zonas naturales adyacentes no varió entre durante y después de la floración masiva del cultivo. Sin embargo, a escala de paisaje, tanto la abundancia de la abeja de la miel como de las otras abejas fueron menores en áreas naturales adyacentes que en áreas distantes a los cultivos. Estos resultados muestran que los cultivos de floración masiva pueden influir en la polinización del paisaje circundante compitiendo por polinizadores generalistas como la abeja de la miel con las plantas nativas. Las características de la especie de cultivo, así como del paisaje circundante, modulan y determinan el papel de los cultivos de floración masiva como fuentes o sumideros de polinizadores silvestres para las áreas naturales del paisaje circundante. informacion [at]ebd.csic.es: Montero-Castaño et al (2016) Mass flowering crops in a patchy agricultural landscape can reduce bee abundance in adjacent shrublands. Agric Ecosyst Environ 223, 22–30 doi:10.1016/j.agee.2016.02.019


http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0167880916300950