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La optimización de protocolos para la extracción de ADN de muestras fecales

La secuenciación de alto rendimiento ofrece nuevas posibilidades en ecología molecular y biología de la conservación. Sin embargo, el potencial de esta técnica no ha sido totalmente explotado para estudios no invasivos, a partir de muestras fecales, de fauna silvestre. La secuenciación de alto rendimiento permite la secuenciación de fragmentos de ADN cortos y podría permitir el genotipado simultáneo de un gran número de muestras y marcadores a un bajo coste. La aplicación de estas técnicas a muestras fecales de fauna silvestre ha sido obstaculizada por la gran cantidad de trabajo requerido en varios pasos, desde la recolección de muestras hasta la secuenciación. Se han evaluado protocolos alternativos que podrían permitir un mayor rendimiento en dos de estos pasos: muestreo de campo y extracción de ADN. En este trabajo se compararon dos métodos distintos de conservación de las muestras obtenidas en el campo y siete métodos de extracción de ADN para heces de lobos (Canis lupus). Se observó una gran variación en el éxito de genotipado según los protocolos que se sigan. El método de muestreo de campo basado en frotado superficial de los excrementos dio resultados peores que la recolección de un fragmento del excremento. Por otro lado, los protocolos para la extracción de ADN mostraban resultados muy variables y ofrecen mucho margen de optimización y mejora. La optimización de protocolos puede llevar a un monitoreo no invasivo mucho más eficiente, económico y con mayor rendimiento. La selección de marcadores apropiados sigue siendo de importancia vital para incrementar el éxito de genotipado. informacion[at]ebd.csic.es: Sarabia et al (2020) Towards high-throughput analyses of fecal samples from wildlife. Animal Biodiver Conserv 43.2: 271–283 Doi 10.32800/abc.2020.43.0271


http://abc.museucienciesjournals.cat/volum-43-2-2020/towards-high-throughput-analyses-of-fecal-samples-from-wildlife/?lang=en
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Mortalidad y reproducción del alimoche en el valle del Ebro

Mortalidad y reproducción del alimoche en el valle del Ebro

En especies longevas la relación entre la edad y sexo de los individuos y sus patrones de supervivencia y reproducción determina la evolución de las estrategias de vida y la dinámica de sus poblaciones. Los resultados de este estudio proporcionan una de las primeras evidencias de mortalidad y reproducción diferencial por sexos y edades entre alimoches adultos reproductores. Se recopilaron datos durante más de 30 años en la península ibérica, muestra que las hembras comienzan la reproducción a edades más tempranas y variables que los machos, que suelen comenzar a los 7 años de edad. Los resultados constatan una mejora relacionada con la edad en el éxito reproductivo a nivel de población en relación a la aparición y desaparición selectiva de fenotipos de diferente calidad pero no relacionados con la edad del individuo. Se evidencia una alta mortalidad en machos reproductores jóvenes y hembras de todas las edades, que podría estar relacionada con diferencias en la dieta, estrategias de búsqueda de alimento y/o susceptibilidad a tóxicos entre sexos y grupos de edad. Estas diferencias de mortalidad pueden tener grandes implicaciones para la conservación de la especie y podrían responder tanto a mecanismos evolutivos ligados a los costes del inicio de la reproducción como a factores de mortalidad de origen humano. informacion[at]ebd.csic.es: Sanz-Aguilar (2017) Sex- and age-dependent patterns of survival and breeding success in a long-lived endangered avian scavenger. Sci Rep 7, 40204 doi: 10.1038/srep40204


http://www.nature.com/articles/srep40204