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La optimización de protocolos para la extracción de ADN de muestras fecales

La secuenciación de alto rendimiento ofrece nuevas posibilidades en ecología molecular y biología de la conservación. Sin embargo, el potencial de esta técnica no ha sido totalmente explotado para estudios no invasivos, a partir de muestras fecales, de fauna silvestre. La secuenciación de alto rendimiento permite la secuenciación de fragmentos de ADN cortos y podría permitir el genotipado simultáneo de un gran número de muestras y marcadores a un bajo coste. La aplicación de estas técnicas a muestras fecales de fauna silvestre ha sido obstaculizada por la gran cantidad de trabajo requerido en varios pasos, desde la recolección de muestras hasta la secuenciación. Se han evaluado protocolos alternativos que podrían permitir un mayor rendimiento en dos de estos pasos: muestreo de campo y extracción de ADN. En este trabajo se compararon dos métodos distintos de conservación de las muestras obtenidas en el campo y siete métodos de extracción de ADN para heces de lobos (Canis lupus). Se observó una gran variación en el éxito de genotipado según los protocolos que se sigan. El método de muestreo de campo basado en frotado superficial de los excrementos dio resultados peores que la recolección de un fragmento del excremento. Por otro lado, los protocolos para la extracción de ADN mostraban resultados muy variables y ofrecen mucho margen de optimización y mejora. La optimización de protocolos puede llevar a un monitoreo no invasivo mucho más eficiente, económico y con mayor rendimiento. La selección de marcadores apropiados sigue siendo de importancia vital para incrementar el éxito de genotipado. informacion[at]ebd.csic.es: Sarabia et al (2020) Towards high-throughput analyses of fecal samples from wildlife. Animal Biodiver Conserv 43.2: 271–283 Doi 10.32800/abc.2020.43.0271


http://abc.museucienciesjournals.cat/volum-43-2-2020/towards-high-throughput-analyses-of-fecal-samples-from-wildlife/?lang=en
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Patos como vectores de dispersión para una amplia gama de plantas

Patos como vectores de dispersión para una amplia gama de plantas

Los patos nadadores son ampliamente reconocidos como vectores importantes de dispersión para plantas acuáticas; sin embargo en los ecosistemas terrestres este papel se considera como irrelevante. En este estudio, basado en una revisión de los contenidos del sistema digestivo, se identificaron las especies de plantas dispersadas por siete especies de patos en Europa, concretamente 445 especies pertenecientes a 189 géneros y 57 familias. Estas especies se encuentran en un amplio abanico de hábitats terrestres y de humedales, incluyendo los rangos casi completos de estados de nutrientes, humedad e intensidad de luz asociados a la flora europea. Representan una amplia diversidad de síndromes de dispersión y, en la mayoría de las especies (62%), en las bases de datos botánicos no aparecen como susceptibles a ser dispersadas por animales. Las plantas de humedales representan tan solo el 40% de las especies dispersadas. Los patos se alimentan de manera oportunista de una amplia selección de las especies de plantas halladas en los paisajes donde viven. La dispersión de semillas por endozoocoria por los patos parece ser una vía de dispersión importante para una variedad de plantas mucho más amplia que se ha reconocido anteriormente. informacion[at]ebd.csic.es: Soons et al (2016) Seed dispersal by dabbling ducks: an overlooked dispersal pathway for a broad spectrum of plant species. J Ecol doi:10.1111/1365-2745.12531


http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/1365-2745.12531/full