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La optimización de protocolos para la extracción de ADN de muestras fecales

La secuenciación de alto rendimiento ofrece nuevas posibilidades en ecología molecular y biología de la conservación. Sin embargo, el potencial de esta técnica no ha sido totalmente explotado para estudios no invasivos, a partir de muestras fecales, de fauna silvestre. La secuenciación de alto rendimiento permite la secuenciación de fragmentos de ADN cortos y podría permitir el genotipado simultáneo de un gran número de muestras y marcadores a un bajo coste. La aplicación de estas técnicas a muestras fecales de fauna silvestre ha sido obstaculizada por la gran cantidad de trabajo requerido en varios pasos, desde la recolección de muestras hasta la secuenciación. Se han evaluado protocolos alternativos que podrían permitir un mayor rendimiento en dos de estos pasos: muestreo de campo y extracción de ADN. En este trabajo se compararon dos métodos distintos de conservación de las muestras obtenidas en el campo y siete métodos de extracción de ADN para heces de lobos (Canis lupus). Se observó una gran variación en el éxito de genotipado según los protocolos que se sigan. El método de muestreo de campo basado en frotado superficial de los excrementos dio resultados peores que la recolección de un fragmento del excremento. Por otro lado, los protocolos para la extracción de ADN mostraban resultados muy variables y ofrecen mucho margen de optimización y mejora. La optimización de protocolos puede llevar a un monitoreo no invasivo mucho más eficiente, económico y con mayor rendimiento. La selección de marcadores apropiados sigue siendo de importancia vital para incrementar el éxito de genotipado. informacion[at]ebd.csic.es: Sarabia et al (2020) Towards high-throughput analyses of fecal samples from wildlife. Animal Biodiver Conserv 43.2: 271–283 Doi 10.32800/abc.2020.43.0271


http://abc.museucienciesjournals.cat/volum-43-2-2020/towards-high-throughput-analyses-of-fecal-samples-from-wildlife/?lang=en
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Riesgo de transmisión de patógenos por gaviotas que visitan zonas humanizadas

Riesgo de transmisión de patógenos por gaviotas que visitan zonas humanizadas

La vida silvestre que utiliza los hábitats creados por el hombre hospeda y propaga patógenos bacterianos. Esto perfila la epidemiología de las enfermedades infecciosas y facilita la propagación de patógenos entre la vida silvestre y los humanos. Este es un problema global, pero se sabe poco sobre el potencial de diseminación de los animales infectados con patógenos. La forma en que se podría llenar este vacío de conocimiento a escalas regionales se demuestra combinando el diagnóstico de patógenos con técnicas moleculares con el seguimiento por GPS de gaviotas infectadas por patógenos. Concretamente, se generaron mapas de riesgo de los patógenos de Salmonella, Campylobacter y Chlamydia, basados en los movimientos espaciales de gaviota patiamarilla (Larus michahellis) infectadas por patógenos y equipadas con localizadores GPS. Además, al cruzar esta información espacial con la información del hábitat, se identificaron hábitats críticos para la posible transmisión de estas bacterias en el sur de Europa. El uso de hábitats creados por el hombre por las gaviotas infectadas podría aumentar potencialmente el riesgo potencial de transmisión bidireccional directa e indirecta de patógenos entre humanos y vida silvestre. Estos hallazgos muestran que la vida silvestre infectada por patógenos equipada con localizadores GPS puede proporcionar información precisa sobre el riesgo de propagación espacial de las bacterias zoonóticas. La integración del seguimiento por GPS con las aproximaciones epidemiológicas clásicas puede ayudar a mejorar los programas de vigilancia y control de zoonosis. informacion[at]ebd.csic.es: Navarro et al (2019) Pathogen transmission risk by opportunistic gulls moving across human landscapes. Scientific Reports 9:10659 DOI 10.1038/s41598-019-46326-1


https://www.nature.com/articles/s41598-019-46326-1