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La optimización de protocolos para la extracción de ADN de muestras fecales

La secuenciación de alto rendimiento ofrece nuevas posibilidades en ecología molecular y biología de la conservación. Sin embargo, el potencial de esta técnica no ha sido totalmente explotado para estudios no invasivos, a partir de muestras fecales, de fauna silvestre. La secuenciación de alto rendimiento permite la secuenciación de fragmentos de ADN cortos y podría permitir el genotipado simultáneo de un gran número de muestras y marcadores a un bajo coste. La aplicación de estas técnicas a muestras fecales de fauna silvestre ha sido obstaculizada por la gran cantidad de trabajo requerido en varios pasos, desde la recolección de muestras hasta la secuenciación. Se han evaluado protocolos alternativos que podrían permitir un mayor rendimiento en dos de estos pasos: muestreo de campo y extracción de ADN. En este trabajo se compararon dos métodos distintos de conservación de las muestras obtenidas en el campo y siete métodos de extracción de ADN para heces de lobos (Canis lupus). Se observó una gran variación en el éxito de genotipado según los protocolos que se sigan. El método de muestreo de campo basado en frotado superficial de los excrementos dio resultados peores que la recolección de un fragmento del excremento. Por otro lado, los protocolos para la extracción de ADN mostraban resultados muy variables y ofrecen mucho margen de optimización y mejora. La optimización de protocolos puede llevar a un monitoreo no invasivo mucho más eficiente, económico y con mayor rendimiento. La selección de marcadores apropiados sigue siendo de importancia vital para incrementar el éxito de genotipado. informacion[at]ebd.csic.es: Sarabia et al (2020) Towards high-throughput analyses of fecal samples from wildlife. Animal Biodiver Conserv 43.2: 271–283 Doi 10.32800/abc.2020.43.0271


http://abc.museucienciesjournals.cat/volum-43-2-2020/towards-high-throughput-analyses-of-fecal-samples-from-wildlife/?lang=en
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Una elevada presión ganadera influye negativamente en la condición corporal del guirre canario

Una elevada presión ganadera influye negativamente en la condición corporal del guirre canario

Rasgos individuales como la masa corporal pueden servir como señales de alerta temprana de cambios en la salud de poblaciones de animales que se enfrentan a impactos ambientales. Un estudio sobre los guirres o alimoches canarios, una especie de buitre de pequeño tamaño endémico del archipiélago, ha comprobado que los guirres tienen un peso corporal más bajo cuando aumenta la presión ganadera en los territorios en los que habita. Se esperaría que un aumento de ganado en una región implicaría más alimento para las aves carroñeras, como es el caso del guirre, y mejores condiciones de salud. No obstante, en este caso resulta que los restos de ganado no cubren todas las necesidades de la población de guirres. Se deduce que los cadáveres de pequeños animales silvestres como conejos, aves y reptiles son muy importantes desde el punto de vista cualitativo, y el sobrepastoreo reduciría su disponibilidad. Ello muestra que la conservación de los buitres no pasa sólo por garantizar el alimento, sino que debe conservarse la integridad de los ecosistemas y sus funciones y a ese nivel, una gestión ganadera adecuada es fundamental. Desde el año 1998 se lleva a cabo un programa de seguimiento del guirre en las Islas Canarias. La isla de Fuerteventura es una de las regiones donde se desarrolla el programa. La producción primaria (crecimiento vegetal) de esta isla se ve determinada por la cantidad de lluvias, pero una elevada presión ganadera afecta negativamente la disponibilidad de alimento vegetal. En otras palabras, un aumento de la cabaña ganadera trae consigo una disminución de la vegetación, e implicaría también una menor presencia de especies silvestres, como conejos, aves o reptiles, cuyos cadáveres forman parte de la dieta del guirre. El peso de los guirres también ha ido disminuyendo conforme su población ha ido creciendo, por un efecto denso-dependiente: a más individuos, menos recursos por cabeza. Estos patrones generales están modelados además por variables individuales como la edad y el hecho de tener o no un territorio. Este estudio demuestra que los rasgos individuales pueden ser herramientas extremadamente fiables para comprender mejor la respuesta de los consumidores secundarios a los cambios ambientales naturales y los provocados por el hombre, actuales y futuros. Entender las complejas relaciones entre los factores a nivel de ecosistema, la estructura de la población y las características individuales que determinan la condición corporal de los animales ayudará a definir estrategias de gestión para ésta y otras poblaciones, ecológicamente similares, en peligro de extinción. informacion[at]ebd.csic.es: Donázar et al (2020) Too much is bad: increasing numbers of livestock and conspecifics reduce body mass in an avian scavenger. Ecol Appl DOI 10.1002/eap.2125


https://esajournals.onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1002/eap.2125