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La superficie inundada en la marisma es de un 78% pero la profundidad es escasa. Por otra parte, sólo el 1,9% de las lagunas temporales están inundadas. Las precipitaciones crean una oportunidad...

El ruido del tráfico es perjudicial para el desarrollo de las crías de aves

Un estudio con participación del CSIC revela por primera vez que el ruido de los coches perjudica a los individuos a lo largo de su vida incluso años después de la exposición

El comercio ilegal de especies, un problema para la biodiversidad y riesgo para la salud

Un estudio de la Estación Biológica de Doñana y la Universidad Pablo de Olavide detecta mascotas de origen salvaje en el 95% de las poblaciones del Neotrópico y alerta del peligro de brotes zoonóticos

La urbanización y la pérdida de vegetación están cambiando características clave de comunidades de escarabajos y arañas

La urbanización está favoreciendo a especies de escarabajos más pequeñas y especies de arañas más grandes con mayor capacidad de dispersión. La pérdida de áreas boscosas se vincula con una...

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Caracterización del genoma accesible en el parásito de la malaria humana Plasmodium falciparum

Caracterización del genoma accesible en el parásito de la malaria humana Plasmodium falciparum

La malaria humana es una enfermedad devastadora y causa de pobreza en países en vías de desarrollo. Para desarrollarse y adaptarse a las condiciones cambiantes dentro del huésped Plasmodium falciparum experimenta cambios drásticos en la expresión de los genes. Con el objetivo de identificar regiones reguladoras en el genoma del parásito, se ha caracterizado el perfil de accesibilidad a la cromatina en dos líneas clonales en cuatro etapas del desarrollo durante el ciclo intraeritrocítico en sangre mediante la técnica del ATAC-seq. Se encontró que las regiones abiertas de la cromatina localizan preferentemente en los sitios de inicio de la transcripción (TSS). La accesibilidad a la cromatina por ATAC-seq es predictiva del nivel de transcripción activa y de los niveles de enriquecimiento de marcas de histonas H3K9ac y H3K4me3. Este ensayo ha permitido además identificar nuevas regiones reguladoras incluyendo TSS y elementos tipo enhancer. En este estudio se muestra que la dinámica de la accesibilidad de la cromatina coincide con los patrones temporales de expresión durante el desarrollo. El análisis de motivos enriquecidos en las regiones reguladoras activas específicas en cada etapa permite predecir los sitios de unión in vivo y la función de múltiples factores de transcripción ApiAP2. Por último, el estado de expresión activo de genes clonales variantes implicados en virulencia:  eba, phist, var y clag; está asociado a una señal de ATAC-seq diferencial en el promotor. En conjunto, este estudio identifica las regiones reguladoras del genoma con un papel esencial en el desarrollo del parásito y en la expresión clonal variante en P. falciparum. informacion[at]ebd.csic.es: Ruiz et al (2018) Characterization of the accessible genome in the human malaria parasite Plasmodium falciparum. Nucleic Acids Res https://doi.org/10.1093/nar/gky643


https://academic.oup.com/nar/advance-article/doi/10.1093/nar/gky643/5054866?guestAccessKey=c45cf7d4-f086-449f-a39e-246f7a8122fe